RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545247.6

TSG101-210, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 3

Gene TSG101, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-210ENST00000545247 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.76■■■■■ 5.24
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TSG101-210ENST00000545247 ABCC9O60706 1549 aa42.8■■■■■ 4.44
TSG101-210ENST00000545247 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.73■■■■■ 4.11
TSG101-210ENST00000545247 NACADO15069 1562 aa40.45■■■■■ 4.07
TSG101-210ENST00000545247 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.33■■■■■ 4.05
TSG101-210ENST00000545247 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.12■■■■■ 4.01
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TSG101-210ENST00000545247 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.52■■■■□ 3.76
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TSG101-210ENST00000545247 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.26■■■■□ 3.56
TSG101-210ENST00000545247 SMARCA2P51531 1590 aa37.15■■■■□ 3.54
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TSG101-210ENST00000545247 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
TSG101-210ENST00000545247 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.87■■■■□ 3.49
TSG101-210ENST00000545247 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.84■■■■□ 3.49
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TSG101-210ENST00000545247 CUX2O14529 1486 aa36.8■■■■□ 3.48
TSG101-210ENST00000545247 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.72■■■■□ 3.47
TSG101-210ENST00000545247 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.5■■■■□ 3.43
TSG101-210ENST00000545247 WIZO95785 1651 aa36.43■■■■□ 3.42
TSG101-210ENST00000545247 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
TSG101-210ENST00000545247 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.35■■■■□ 3.41
TSG101-210ENST00000545247 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.26■■■■□ 3.4
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TSG101-210ENST00000545247 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
TSG101-210ENST00000545247 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.98■■■■□ 3.35
TSG101-210ENST00000545247 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
TSG101-210ENST00000545247 WDR62O43379 1518 aa35.89■■■■□ 3.34
TSG101-210ENST00000545247 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.85■■■■□ 3.33
TSG101-210ENST00000545247 CFTRP13569 1480 aa35.82■■■■□ 3.32
TSG101-210ENST00000545247 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.82■■■■□ 3.32
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TSG101-210ENST00000545247 PRDM2Q13029 1718 aa35.54■■■■□ 3.28
TSG101-210ENST00000545247 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.53■■■■□ 3.28
TSG101-210ENST00000545247 TRIM41Q8WV44 630 aa35.18■■■■□ 3.22
TSG101-210ENST00000545247 TOPBP1Q92547 1522 aa35.16■■■■□ 3.22
TSG101-210ENST00000545247 OSCARQ8IYS5 282 aa35.14■■■■□ 3.22
TSG101-210ENST00000545247 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
TSG101-210ENST00000545247 IFT140Q96RY7 1462 aa35.11■■■■□ 3.21
TSG101-210ENST00000545247 ABCC8Q09428 1581 aa35.04■■■■□ 3.2
TSG101-210ENST00000545247 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.04■■■■□ 3.2
TSG101-210ENST00000545247 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
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TSG101-210ENST00000545247 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.73■■■■□ 3.15
TSG101-210ENST00000545247 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.73■■■■□ 3.15
TSG101-210ENST00000545247 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.71■■■■□ 3.15
TSG101-210ENST00000545247 CHD1O14646 1710 aa34.69■■■■□ 3.14
TSG101-210ENST00000545247 SOGA1O94964 1423 aa34.64■■■■□ 3.14
TSG101-210ENST00000545247 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.61■■■■□ 3.13
TSG101-210ENST00000545247 ARHGEF11O15085 1522 aa34.6■■■■□ 3.13
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TSG101-210ENST00000545247 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
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TSG101-210ENST00000545247 FBLN2P98095 1184 aa34.55■■■■□ 3.12
TSG101-210ENST00000545247 WDR97A6NE52 1622 aa34.44■■■■□ 3.1
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TSG101-210ENST00000545247 GRIN2BQ13224 1484 aa34.32■■■■□ 3.08
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TSG101-210ENST00000545247 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.23■■■■□ 3.07
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TSG101-210ENST00000545247 SYNJ2O15056 1496 aa34.2■■■■□ 3.06
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TSG101-210ENST00000545247 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.07■■■■□ 3.04
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TSG101-210ENST00000545247 CEP170Q5SW79 1584 aa33.81■■■■□ 3
TSG101-210ENST00000545247 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.78■■■■□ 3
TSG101-210ENST00000545247 NUP160Q12769 1436 aa33.77■■■■□ 3
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TSG101-210ENST00000545247 SHROOM2Q13796 1616 aa33.64■■■□□ 2.98
TSG101-210ENST00000545247 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
TSG101-210ENST00000545247 JPH4Q96JJ6 628 aa33.43■■■□□ 2.94
TSG101-210ENST00000545247 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.43■■■□□ 2.94
TSG101-210ENST00000545247 IGF1RP08069 1367 aa33.36■■■□□ 2.93
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