RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416802.1

PREB-203, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 4

Gene PREB, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-203ENST00000416802 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.63■■■■■ 7.14
PREB-203ENST00000416802 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.11■■■■■ 6.09
PREB-203ENST00000416802 ABCC9O60706 1549 aa52.1■■■■■ 5.93
PREB-203ENST00000416802 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.06■■■■■ 5.6
PREB-203ENST00000416802 NACADO15069 1562 aa49.97■■■■■ 5.59
PREB-203ENST00000416802 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.77■■■■■ 5.56
PREB-203ENST00000416802 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.65■■■■■ 5.54
PREB-203ENST00000416802 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.63■■■■■ 5.54
PREB-203ENST00000416802 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.36■■■■■ 5.49
PREB-203ENST00000416802 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.97■■■■■ 5.43
PREB-203ENST00000416802 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.64■■■■■ 5.38
PREB-203ENST00000416802 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.6■■■■■ 5.37
PREB-203ENST00000416802 SCRIBQ14160 1630 aa48.39■■■■■ 5.34
PREB-203ENST00000416802 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.06■■■■■ 5.28
PREB-203ENST00000416802 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.05■■■■■ 5.28
PREB-203ENST00000416802 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
PREB-203ENST00000416802 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.16■■■■■ 5.14
PREB-203ENST00000416802 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.84■■■■■ 5.09
PREB-203ENST00000416802 SMARCA4P51532 1647 aa46.31■■■■■ 5
PREB-203ENST00000416802 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
PREB-203ENST00000416802 NCAPD3P42695 1498 aa46.13■■■■■ 4.98
PREB-203ENST00000416802 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.11■■■■■ 4.97
PREB-203ENST00000416802 SMARCA2P51531 1590 aa46.03■■■■■ 4.96
PREB-203ENST00000416802 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.94■■■■■ 4.94
PREB-203ENST00000416802 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.9■■■■■ 4.94
PREB-203ENST00000416802 HMGXB3Q12766 1538 aa45.87■■■■■ 4.93
PREB-203ENST00000416802 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
PREB-203ENST00000416802 WIZO95785 1651 aa45.44■■■■■ 4.86
PREB-203ENST00000416802 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
PREB-203ENST00000416802 NESP48681 1621 aa45.04■■■■■ 4.8
PREB-203ENST00000416802 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
PREB-203ENST00000416802 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.93■■■■■ 4.78
PREB-203ENST00000416802 ERCC6Q03468 1493 aa44.89■■■■■ 4.78
PREB-203ENST00000416802 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.75■■■■■ 4.75
PREB-203ENST00000416802 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.6■■■■■ 4.73
PREB-203ENST00000416802 CUX2O14529 1486 aa44.55■■■■■ 4.72
PREB-203ENST00000416802 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.52■■■■■ 4.72
PREB-203ENST00000416802 CFTRP13569 1480 aa44.47■■■■■ 4.71
PREB-203ENST00000416802 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
PREB-203ENST00000416802 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.41■■■■■ 4.7
PREB-203ENST00000416802 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.21■■■■■ 4.67
PREB-203ENST00000416802 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.17■■■■■ 4.66
PREB-203ENST00000416802 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.16■■■■■ 4.66
PREB-203ENST00000416802 PRDM2Q13029 1718 aa44.11■■■■■ 4.65
PREB-203ENST00000416802 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.1■■■■■ 4.65
PREB-203ENST00000416802 WDR62O43379 1518 aa44.05■■■■■ 4.64
PREB-203ENST00000416802 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
PREB-203ENST00000416802 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
PREB-203ENST00000416802 TOPBP1Q92547 1522 aa43.5■■■■■ 4.55
PREB-203ENST00000416802 ABCC8Q09428 1581 aa43.49■■■■■ 4.55
PREB-203ENST00000416802 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.43■■■■■ 4.54
PREB-203ENST00000416802 IFT140Q96RY7 1462 aa43.27■■■■■ 4.52
PREB-203ENST00000416802 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.49
PREB-203ENST00000416802 CUX1P39880 1505 aa43.11■■■■■ 4.49
PREB-203ENST00000416802 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
PREB-203ENST00000416802 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
PREB-203ENST00000416802 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.98■■■■■ 4.47
PREB-203ENST00000416802 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
PREB-203ENST00000416802 SOGA1O94964 1423 aa42.92■■■■■ 4.46
PREB-203ENST00000416802 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.92■■■■■ 4.46
PREB-203ENST00000416802 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.82■■■■■ 4.457e-10■■■■■ 51.4
PREB-203ENST00000416802 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.73■■■■■ 4.43
PREB-203ENST00000416802 WDR97A6NE52 1622 aa42.72■■■■■ 4.43
PREB-203ENST00000416802 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.7■■■■■ 4.43
PREB-203ENST00000416802 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
PREB-203ENST00000416802 TOP2BQ02880 1626 aa42.69■■■■■ 4.42
PREB-203ENST00000416802 SYNJ1O43426 1573 aa42.66■■■■■ 4.42
PREB-203ENST00000416802 OSCARQ8IYS5 282 aa42.65■■■■■ 4.42
PREB-203ENST00000416802 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.57■■■■■ 4.41
PREB-203ENST00000416802 GRIN2BQ13224 1484 aa42.45■■■■■ 4.39
PREB-203ENST00000416802 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.43■■■■■ 4.38
PREB-203ENST00000416802 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.42■■■■■ 4.38
PREB-203ENST00000416802 CHD1O14646 1710 aa42.41■■■■■ 4.38
PREB-203ENST00000416802 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.41■■■■■ 4.38
PREB-203ENST00000416802 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
PREB-203ENST00000416802 PBRM1Q86U86 1689 aa42.36■■■■■ 4.37
PREB-203ENST00000416802 FBLN2P98095 1184 aa42.27■■■■■ 4.36
PREB-203ENST00000416802 SYNJ2O15056 1496 aa42.21■■■■■ 4.35
PREB-203ENST00000416802 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
PREB-203ENST00000416802 TRIM41Q8WV44 630 aa42.08■■■■■ 4.33
PREB-203ENST00000416802 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.06■■■■■ 4.32
PREB-203ENST00000416802 ADAMTS12P58397 1594 aa42.01■■■■■ 4.32
PREB-203ENST00000416802 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42■■■■■ 4.31
PREB-203ENST00000416802 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42■■■■■ 4.31
PREB-203ENST00000416802 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42■■■■■ 4.31
PREB-203ENST00000416802 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.98■■■■■ 4.31
PREB-203ENST00000416802 ARHGEF11O15085 1522 aa41.97■■■■■ 4.31
PREB-203ENST00000416802 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.94■■■■■ 4.3
PREB-203ENST00000416802 GRIN2AQ12879 1464 aa41.92■■■■■ 4.3
PREB-203ENST00000416802 KIF27Q86VH2 1401 aa41.85■■■■■ 4.29
PREB-203ENST00000416802 NUP160Q12769 1436 aa41.76■■■■■ 4.28
PREB-203ENST00000416802 IGF1RP08069 1367 aa41.74■■■■■ 4.27
PREB-203ENST00000416802 CEP170Q5SW79 1584 aa41.72■■■■■ 4.27
PREB-203ENST00000416802 ARAP1Q96P48 1450 aa41.63■■■■■ 4.25
PREB-203ENST00000416802 CUL7Q14999 1698 aa41.63■■■■■ 4.25
PREB-203ENST00000416802 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.55■■■■■ 4.24
PREB-203ENST00000416802 SHROOM2Q13796 1616 aa41.48■■■■■ 4.23
PREB-203ENST00000416802 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.46■■■■■ 4.23
PREB-203ENST00000416802 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.44■■■■■ 4.22
PREB-203ENST00000416802 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.37■■■■■ 4.21
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