RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563260.1

CDAN1-203, Transcript of codanin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CDAN1, Length 285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAN1-203ENST00000563260 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.17■■■■■ 7.86
CDAN1-203ENST00000563260 ABCC9O60706 1549 aa58.12■■■■■ 6.9
CDAN1-203ENST00000563260 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.82■■■■■ 6.85
CDAN1-203ENST00000563260 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.19■■■■■ 6.42
CDAN1-203ENST00000563260 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.81■■■■■ 6.36
CDAN1-203ENST00000563260 NACADO15069 1562 aa54.7■■■■■ 6.35
CDAN1-203ENST00000563260 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.18■■■■■ 6.26
CDAN1-203ENST00000563260 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.99■■■■■ 6.23
CDAN1-203ENST00000563260 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.99■■■■■ 6.23
CDAN1-203ENST00000563260 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.83■■■■■ 6.21
CDAN1-203ENST00000563260 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.61■■■■■ 6.17
CDAN1-203ENST00000563260 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.14■■■■■ 6.1
CDAN1-203ENST00000563260 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53■■■■■ 6.07
CDAN1-203ENST00000563260 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.87■■■■■ 6.05
CDAN1-203ENST00000563260 SCRIBQ14160 1630 aa52.64■■■■■ 6.02
CDAN1-203ENST00000563260 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.52■■■■■ 6
CDAN1-203ENST00000563260 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.41■■■■■ 5.98
CDAN1-203ENST00000563260 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.33■■■■■ 5.97
CDAN1-203ENST00000563260 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.6■■■■■ 5.69
CDAN1-203ENST00000563260 NCAPD3P42695 1498 aa50.48■■■■■ 5.67
CDAN1-203ENST00000563260 CUX2O14529 1486 aa50.28■■■■■ 5.64
CDAN1-203ENST00000563260 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.28■■■■■ 5.64
CDAN1-203ENST00000563260 ERCC6Q03468 1493 aa50.21■■■■■ 5.63
CDAN1-203ENST00000563260 SMARCA4P51532 1647 aa50.18■■■■■ 5.62
CDAN1-203ENST00000563260 SMARCA2P51531 1590 aa50.14■■■■■ 5.62
CDAN1-203ENST00000563260 HMGXB3Q12766 1538 aa50.13■■■■■ 5.62
CDAN1-203ENST00000563260 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.85■■■■■ 5.57
CDAN1-203ENST00000563260 NESP48681 1621 aa49.83■■■■■ 5.57
CDAN1-203ENST00000563260 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.78■■■■■ 5.56
CDAN1-203ENST00000563260 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.7■■■■■ 5.55
CDAN1-203ENST00000563260 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.48■■■■■ 5.51
CDAN1-203ENST00000563260 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.45■■■■■ 5.51
CDAN1-203ENST00000563260 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.45■■■■■ 5.51
CDAN1-203ENST00000563260 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.23■■■■■ 5.47
CDAN1-203ENST00000563260 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.12■■■■■ 5.45
CDAN1-203ENST00000563260 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.9■■■■■ 5.42
CDAN1-203ENST00000563260 WIZO95785 1651 aa48.85■■■■■ 5.41
CDAN1-203ENST00000563260 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.77■■■■■ 5.4
CDAN1-203ENST00000563260 WDR62O43379 1518 aa48.69■■■■■ 5.39
CDAN1-203ENST00000563260 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.49■■■■■ 5.35
CDAN1-203ENST00000563260 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.39■■■■■ 5.34
CDAN1-203ENST00000563260 CFTRP13569 1480 aa48.3■■■■■ 5.32
CDAN1-203ENST00000563260 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.25■■■■■ 5.32
CDAN1-203ENST00000563260 TRIM41Q8WV44 630 aa48.22■■■■■ 5.31
CDAN1-203ENST00000563260 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.22■■■■■ 5.31
CDAN1-203ENST00000563260 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.04■■■■■ 5.28
CDAN1-203ENST00000563260 PRDM2Q13029 1718 aa47.87■■■■■ 5.25
CDAN1-203ENST00000563260 OSCARQ8IYS5 282 aa47.8■■■■■ 5.24
CDAN1-203ENST00000563260 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.62■■■■■ 5.21
CDAN1-203ENST00000563260 IFT140Q96RY7 1462 aa47.53■■■■■ 5.2
CDAN1-203ENST00000563260 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.5■■■■■ 5.19
CDAN1-203ENST00000563260 TOPBP1Q92547 1522 aa47.44■■■■■ 5.18
CDAN1-203ENST00000563260 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.36■■■■■ 5.17
CDAN1-203ENST00000563260 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.36■■■■■ 5.17
CDAN1-203ENST00000563260 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.36■■■■■ 5.17
CDAN1-203ENST00000563260 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
CDAN1-203ENST00000563260 ABCC8Q09428 1581 aa47.27■■■■■ 5.16
CDAN1-203ENST00000563260 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.25■■■■■ 5.15
CDAN1-203ENST00000563260 ARHGEF11O15085 1522 aa47.16■■■■■ 5.14
CDAN1-203ENST00000563260 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
CDAN1-203ENST00000563260 CHD1O14646 1710 aa46.99■■■■■ 5.11
CDAN1-203ENST00000563260 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.98■■■■■ 5.113e-8■■■■□ 21.1
CDAN1-203ENST00000563260 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.94■■■■■ 5.1
CDAN1-203ENST00000563260 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.75■■■■■ 5.07
CDAN1-203ENST00000563260 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.72■■■■■ 5.07
CDAN1-203ENST00000563260 FBLN2P98095 1184 aa46.68■■■■■ 5.06
CDAN1-203ENST00000563260 ARAP1Q96P48 1450 aa46.68■■■■■ 5.06
CDAN1-203ENST00000563260 SOGA1O94964 1423 aa46.65■■■■■ 5.06
CDAN1-203ENST00000563260 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.61■■■■■ 5.05
CDAN1-203ENST00000563260 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.58■■■■■ 5.05
CDAN1-203ENST00000563260 WDR97A6NE52 1622 aa46.58■■■■■ 5.05
CDAN1-203ENST00000563260 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.54■■■■■ 5.04
CDAN1-203ENST00000563260 CUX1P39880 1505 aa46.49■■■■■ 5.03
CDAN1-203ENST00000563260 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.44■■■■■ 5.02
CDAN1-203ENST00000563260 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.39■■■■■ 5.02
CDAN1-203ENST00000563260 SYNJ1O43426 1573 aa46.35■■■■■ 5.01
CDAN1-203ENST00000563260 GRIN2BQ13224 1484 aa46.34■■■■■ 5.01
CDAN1-203ENST00000563260 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.32■■■■■ 5.01
CDAN1-203ENST00000563260 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
CDAN1-203ENST00000563260 SYNJ2O15056 1496 aa46.25■■■■■ 4.99
CDAN1-203ENST00000563260 PBRM1Q86U86 1689 aa46.2■■■■■ 4.99
CDAN1-203ENST00000563260 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.12■■■■■ 4.97
CDAN1-203ENST00000563260 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.05■■■■■ 4.96
CDAN1-203ENST00000563260 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.03■■■■■ 4.96
CDAN1-203ENST00000563260 GRIN2AQ12879 1464 aa45.76■■■■■ 4.92
CDAN1-203ENST00000563260 ADAMTS12P58397 1594 aa45.74■■■■■ 4.91
CDAN1-203ENST00000563260 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
CDAN1-203ENST00000563260 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.73■■■■■ 4.91
CDAN1-203ENST00000563260 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.67■■■■■ 4.9
CDAN1-203ENST00000563260 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.67■■■■■ 4.9
CDAN1-203ENST00000563260 TOP2BQ02880 1626 aa45.65■■■■■ 4.9
CDAN1-203ENST00000563260 CEP170Q5SW79 1584 aa45.64■■■■■ 4.9
CDAN1-203ENST00000563260 NUP160Q12769 1436 aa45.62■■■■■ 4.89
CDAN1-203ENST00000563260 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.52■■■■■ 4.88
CDAN1-203ENST00000563260 SHROOM2Q13796 1616 aa45.5■■■■■ 4.87
CDAN1-203ENST00000563260 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.45■■■■■ 4.87
CDAN1-203ENST00000563260 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.25■■■■■ 4.83
CDAN1-203ENST00000563260 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
CDAN1-203ENST00000563260 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.11■■■■■ 4.81
CDAN1-203ENST00000563260 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.1■■■■■ 4.81
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