RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.25■■■■□ 3.07
PREB-208ENST00000468045 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.56■■■□□ 2.48
PREB-208ENST00000468045 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PREB-208ENST00000468045 HRCP23327 699 aa30.13■■■□□ 2.41
PREB-208ENST00000468045 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.81■■■□□ 2.36
PREB-208ENST00000468045 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.81■■■□□ 2.36
PREB-208ENST00000468045 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
PREB-208ENST00000468045 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.62■■■□□ 2.33
PREB-208ENST00000468045 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.1■■■□□ 2.25
PREB-208ENST00000468045 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PREB-208ENST00000468045 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.97■■■□□ 2.23
PREB-208ENST00000468045 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.84■■■□□ 2.21
PREB-208ENST00000468045 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
PREB-208ENST00000468045 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
PREB-208ENST00000468045 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PREB-208ENST00000468045 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.43■■■□□ 2.14
PREB-208ENST00000468045 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PREB-208ENST00000468045 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.16■■■□□ 2.1
PREB-208ENST00000468045 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PREB-208ENST00000468045 TRIM41Q8WV44 630 aa27.93■■■□□ 2.06
PREB-208ENST00000468045 NEUROD1Q13562 356 aa27.81■■■□□ 2.04
PREB-208ENST00000468045 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PREB-208ENST00000468045 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
PREB-208ENST00000468045 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.62■■■□□ 2.01
PREB-208ENST00000468045 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PREB-208ENST00000468045 ABCC9O60706 1549 aa27.57■■■□□ 2
PREB-208ENST00000468045 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PREB-208ENST00000468045 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.48■■□□□ 1.99
PREB-208ENST00000468045 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PREB-208ENST00000468045 MYT1Q01538 1121 aa27.44■■□□□ 1.98
PREB-208ENST00000468045 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
PREB-208ENST00000468045 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
PREB-208ENST00000468045 SCRIBQ14160 1630 aa27.31■■□□□ 1.96
PREB-208ENST00000468045 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
PREB-208ENST00000468045 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.98■■□□□ 1.91
PREB-208ENST00000468045 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PREB-208ENST00000468045 MIER1Q8N108 512 aa26.86■■□□□ 1.89
PREB-208ENST00000468045 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.86■■□□□ 1.89
PREB-208ENST00000468045 WIZO95785 1651 aa26.77■■□□□ 1.88
PREB-208ENST00000468045 CEP162Q5TB80 1403 aa26.7■■□□□ 1.86
PREB-208ENST00000468045 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
PREB-208ENST00000468045 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PREB-208ENST00000468045 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.62■■□□□ 1.85
PREB-208ENST00000468045 ABCC8Q09428 1581 aa26.62■■□□□ 1.85
PREB-208ENST00000468045 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PREB-208ENST00000468045 SOGA1O94964 1423 aa26.56■■□□□ 1.84
PREB-208ENST00000468045 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PREB-208ENST00000468045 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.45■■□□□ 1.83
PREB-208ENST00000468045 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.44■■□□□ 1.82
PREB-208ENST00000468045 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PREB-208ENST00000468045 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.39■■□□□ 1.82
PREB-208ENST00000468045 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PREB-208ENST00000468045 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PREB-208ENST00000468045 NACADO15069 1562 aa26.18■■□□□ 1.78
PREB-208ENST00000468045 GOLGA3Q08378 1498 aa26.14■■□□□ 1.77
PREB-208ENST00000468045 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.13■■□□□ 1.77
PREB-208ENST00000468045 BCL11AQ9H165 835 aa26.12■■□□□ 1.77
PREB-208ENST00000468045 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PREB-208ENST00000468045 SMARCA2P51531 1590 aa26.09■■□□□ 1.77
PREB-208ENST00000468045 EEA1Q15075 1411 aa26.05■■□□□ 1.76
PREB-208ENST00000468045 APLP2Q06481 763 aa26.03■■□□□ 1.76
PREB-208ENST00000468045 CLIP1P30622 1438 aa26.01■■□□□ 1.75
PREB-208ENST00000468045 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.98■■□□□ 1.75
PREB-208ENST00000468045 KCNH8Q96L42 1107 aa25.97■■□□□ 1.75
PREB-208ENST00000468045 BCANQ96GW7 911 aa25.96■■□□□ 1.75
PREB-208ENST00000468045 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.91■■□□□ 1.74
PREB-208ENST00000468045 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PREB-208ENST00000468045 SMARCA4P51532 1647 aa25.89■■□□□ 1.73
PREB-208ENST00000468045 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.88■■□□□ 1.73
PREB-208ENST00000468045 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.86■■□□□ 1.73
PREB-208ENST00000468045 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.78■■□□□ 1.72
PREB-208ENST00000468045 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PREB-208ENST00000468045 SYNJ1O43426 1573 aa25.73■■□□□ 1.71
PREB-208ENST00000468045 KIF21BO75037 1637 aa25.72■■□□□ 1.71
PREB-208ENST00000468045 FKBP8Q14318 412 aa25.71■■□□□ 1.71
PREB-208ENST00000468045 ITGAEP38570 1179 aa25.7■■□□□ 1.7
PREB-208ENST00000468045 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
PREB-208ENST00000468045 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PREB-208ENST00000468045 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PREB-208ENST00000468045 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PREB-208ENST00000468045 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PREB-208ENST00000468045 TRIM52Q96A61 297 aa25.47■■□□□ 1.67
PREB-208ENST00000468045 ARAP1Q96P48 1450 aa25.45■■□□□ 1.66
PREB-208ENST00000468045 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.4■■□□□ 1.66
PREB-208ENST00000468045 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.39■■□□□ 1.66
PREB-208ENST00000468045 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PREB-208ENST00000468045 NEFLP07196 543 aa25.36■■□□□ 1.65
PREB-208ENST00000468045 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PREB-208ENST00000468045 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.36■■□□□ 1.65
PREB-208ENST00000468045 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.34■■□□□ 1.65
PREB-208ENST00000468045 MSH5O43196 834 aa25.34■■□□□ 1.65
PREB-208ENST00000468045 MAPKBP1O60336 1514 aa25.29■■□□□ 1.64
PREB-208ENST00000468045 WDR97A6NE52 1622 aa25.27■■□□□ 1.64
PREB-208ENST00000468045 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PREB-208ENST00000468045 CUX2O14529 1486 aa25.26■■□□□ 1.63
PREB-208ENST00000468045 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PREB-208ENST00000468045 PRXQ9BXM0 1461 aa25.21■■□□□ 1.63
PREB-208ENST00000468045 TOP2BQ02880 1626 aa25.15■■□□□ 1.62
PREB-208ENST00000468045 ANP32CO43423 234 aa25.15■■□□□ 1.62
PREB-208ENST00000468045 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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