RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578849.1

RANGRF-204, Transcript of RAN guanine nucleotide release factor, humanhuman

TSL 2

Gene RANGRF, Length 607 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGRF-204ENST00000578849 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.19■■■■■ 6.59
RANGRF-204ENST00000578849 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.96■■■■■ 5.59
RANGRF-204ENST00000578849 ABCC9O60706 1549 aa48.86■■■■■ 5.41
RANGRF-204ENST00000578849 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.05■■■■■ 5.12
RANGRF-204ENST00000578849 NACADO15069 1562 aa47.02■■■■■ 5.12
RANGRF-204ENST00000578849 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.9■■■■■ 5.1
RANGRF-204ENST00000578849 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
RANGRF-204ENST00000578849 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.79■■■■■ 5.08
RANGRF-204ENST00000578849 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.55■■■■■ 5.04
RANGRF-204ENST00000578849 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.87■■■■■ 4.93
RANGRF-204ENST00000578849 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.65■■■■■ 4.9
RANGRF-204ENST00000578849 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.59■■■■■ 4.89
RANGRF-204ENST00000578849 SCRIBQ14160 1630 aa45.5■■■■■ 4.87
RANGRF-204ENST00000578849 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.23■■■■■ 4.83
RANGRF-204ENST00000578849 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.89■■■■■ 4.78
RANGRF-204ENST00000578849 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
RANGRF-204ENST00000578849 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.21■■■■■ 4.67
RANGRF-204ENST00000578849 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.95■■■■■ 4.63
RANGRF-204ENST00000578849 SMARCA4P51532 1647 aa43.58■■■■■ 4.57
RANGRF-204ENST00000578849 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
RANGRF-204ENST00000578849 NCAPD3P42695 1498 aa43.41■■■■■ 4.54
RANGRF-204ENST00000578849 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.38■■■■■ 4.54
RANGRF-204ENST00000578849 SMARCA2P51531 1590 aa43.34■■■■■ 4.53
RANGRF-204ENST00000578849 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.26■■■■■ 4.52
RANGRF-204ENST00000578849 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.21■■■■■ 4.51
RANGRF-204ENST00000578849 HMGXB3Q12766 1538 aa43.16■■■■■ 4.5
RANGRF-204ENST00000578849 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
RANGRF-204ENST00000578849 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
RANGRF-204ENST00000578849 WIZO95785 1651 aa42.76■■■■■ 4.44
RANGRF-204ENST00000578849 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
RANGRF-204ENST00000578849 NESP48681 1621 aa42.26■■■■■ 4.36
RANGRF-204ENST00000578849 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.23■■■■■ 4.35
RANGRF-204ENST00000578849 ERCC6Q03468 1493 aa42.14■■■■■ 4.34
RANGRF-204ENST00000578849 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.13■■■■■ 4.33
RANGRF-204ENST00000578849 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.97■■■■■ 4.31
RANGRF-204ENST00000578849 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.86■■■■■ 4.29
RANGRF-204ENST00000578849 CFTRP13569 1480 aa41.86■■■■■ 4.29
RANGRF-204ENST00000578849 CUX2O14529 1486 aa41.78■■■■■ 4.28
RANGRF-204ENST00000578849 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.74■■■■■ 4.27
RANGRF-204ENST00000578849 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
RANGRF-204ENST00000578849 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
RANGRF-204ENST00000578849 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.6■■■■■ 4.25
RANGRF-204ENST00000578849 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.55■■■■■ 4.24
RANGRF-204ENST00000578849 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.51■■■■■ 4.24
RANGRF-204ENST00000578849 PRDM2Q13029 1718 aa41.45■■■■■ 4.23
RANGRF-204ENST00000578849 WDR62O43379 1518 aa41.38■■■■■ 4.21
RANGRF-204ENST00000578849 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
RANGRF-204ENST00000578849 ABCC8Q09428 1581 aa41■■■■■ 4.15
RANGRF-204ENST00000578849 TOPBP1Q92547 1522 aa40.93■■■■■ 4.14
RANGRF-204ENST00000578849 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.88■■■■■ 4.13
RANGRF-204ENST00000578849 IFT140Q96RY7 1462 aa40.71■■■■■ 4.11
RANGRF-204ENST00000578849 CUX1P39880 1505 aa40.59■■■■■ 4.09
RANGRF-204ENST00000578849 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
RANGRF-204ENST00000578849 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.53■■■■■ 4.08
RANGRF-204ENST00000578849 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
RANGRF-204ENST00000578849 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
RANGRF-204ENST00000578849 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.46■■■■■ 4.07
RANGRF-204ENST00000578849 SOGA1O94964 1423 aa40.43■■■■■ 4.06
RANGRF-204ENST00000578849 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.38■■■■■ 4.05
RANGRF-204ENST00000578849 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.35■■■■■ 4.05
RANGRF-204ENST00000578849 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
RANGRF-204ENST00000578849 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.03
RANGRF-204ENST00000578849 TOP2BQ02880 1626 aa40.25■■■■■ 4.03
RANGRF-204ENST00000578849 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.24■■■■■ 4.03
RANGRF-204ENST00000578849 WDR97A6NE52 1622 aa40.23■■■■■ 4.03
RANGRF-204ENST00000578849 SYNJ1O43426 1573 aa40.19■■■■■ 4.02
RANGRF-204ENST00000578849 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
RANGRF-204ENST00000578849 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.11■■■■■ 4.01
RANGRF-204ENST00000578849 OSCARQ8IYS5 282 aa40.05■■■■■ 4
RANGRF-204ENST00000578849 GRIN2BQ13224 1484 aa39.97■■■■□ 3.99
RANGRF-204ENST00000578849 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.96■■■■□ 3.99
RANGRF-204ENST00000578849 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.91■■■■□ 3.98
RANGRF-204ENST00000578849 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.98
RANGRF-204ENST00000578849 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.88■■■■□ 3.97
RANGRF-204ENST00000578849 PBRM1Q86U86 1689 aa39.8■■■■□ 3.96
RANGRF-204ENST00000578849 FBLN2P98095 1184 aa39.76■■■■□ 3.96
RANGRF-204ENST00000578849 CHD1O14646 1710 aa39.76■■■■□ 3.96
RANGRF-204ENST00000578849 SYNJ2O15056 1496 aa39.71■■■■□ 3.95
RANGRF-204ENST00000578849 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
RANGRF-204ENST00000578849 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.64■■■■□ 3.94
RANGRF-204ENST00000578849 KIF27Q86VH2 1401 aa39.54■■■■□ 3.92
RANGRF-204ENST00000578849 ADAMTS12P58397 1594 aa39.53■■■■□ 3.92
RANGRF-204ENST00000578849 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.52■■■■□ 3.92
RANGRF-204ENST00000578849 GRIN2AQ12879 1464 aa39.44■■■■□ 3.9
RANGRF-204ENST00000578849 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.4■■■■□ 3.9
RANGRF-204ENST00000578849 IGF1RP08069 1367 aa39.38■■■■□ 3.89
RANGRF-204ENST00000578849 TRIM41Q8WV44 630 aa39.38■■■■□ 3.89
RANGRF-204ENST00000578849 ARHGEF11O15085 1522 aa39.34■■■■□ 3.89
RANGRF-204ENST00000578849 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.31■■■■□ 3.88
RANGRF-204ENST00000578849 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.31■■■■□ 3.88
RANGRF-204ENST00000578849 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.31■■■■□ 3.88
RANGRF-204ENST00000578849 NUP160Q12769 1436 aa39.3■■■■□ 3.88
RANGRF-204ENST00000578849 CUL7Q14999 1698 aa39.24■■■■□ 3.87
RANGRF-204ENST00000578849 CEP170Q5SW79 1584 aa39.21■■■■□ 3.87
RANGRF-204ENST00000578849 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.14■■■■□ 3.86
RANGRF-204ENST00000578849 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.08■■■■□ 3.85
RANGRF-204ENST00000578849 ARAP1Q96P48 1450 aa39■■■■□ 3.83
RANGRF-204ENST00000578849 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.98■■■■□ 3.83
RANGRF-204ENST00000578849 SHROOM2Q13796 1616 aa38.97■■■■□ 3.83
RANGRF-204ENST00000578849 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.92■■■■□ 3.82
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