Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCNN1GP51170 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 544.8 ms