Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCAP28676 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCAP28676 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 MYT1-202ENST00000360149 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GCAP28676 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms