Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS18Q9P253 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS18Q9P253 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms