Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 223.39■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 520.26■□□□□ 0.832e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)15.52■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 AP006621.5-201ENST00000623846 1139 nt18.29■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 512.43□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 ACAP3-210ENST00000478065 2393 ntTSL 321.1■□□□□ 0.979e-7■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 312.55□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 FAM95C-204ENST00000637322 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.37■□□□□ 0.374e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 FAM95C-203ENST00000637288 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.36■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.184e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.414e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 FAM95C-202ENST00000636756 654 ntTSL 26.78□□□□□ -1.324e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 SH3BP2-213ENST00000508385 876 ntTSL 315.01□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 SH3BP2-224ENST00000513020 868 ntTSL 312.39□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.571e-6■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.281e-6■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 38.95□□□□□ -0.988e-8■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 PCSK6-213ENST00000560902 501 ntTSL 48.31□□□□□ -1.088e-8■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 318.35■□□□□ 0.537e-7■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 WDR1-210ENST00000506246 572 ntTSL 516.1■□□□□ 0.179e-7■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 511.19□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 WDR1-206ENST00000502962 1411 ntTSL 517.18■□□□□ 0.348e-7■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 WDR1-207ENST00000504739 555 ntTSL 316.1■□□□□ 0.178e-7■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 WDR1-218ENST00000515743 4482 ntTSL 513.54□□□□□ -0.248e-7■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 FAM20C-205ENST00000515795 2177 ntTSL 1 (best)21.63■■□□□ 1.052e-6■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 PC-202ENST00000393958 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.695e-7■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 PC-203ENST00000393960 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.75e-7■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.795e-7■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.45e-6■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 LETM1-205ENST00000511977 746 ntTSL 218.6■□□□□ 0.575e-6■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 20.3
SLTMQ9NWH9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.141e-28■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 59.63□□□□□ -0.871e-28■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.031e-28■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 PCBD2-203ENST00000510013 361 ntTSL 54.28□□□□□ -1.721e-28■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 RNF216-201ENST00000389900 3104 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.821e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 RNF216-209ENST00000484458 492 ntTSL 58.61□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-8■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.867e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.857e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.037e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 RTEL1-202ENST00000356810 1339 ntTSL 1 (best)15.57■□□□□ 0.084e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 RTEL1-207ENST00000463361 575 ntTSL 414.08□□□□□ -0.164e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 417.02■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 TRAPPC12-209ENST00000441099 698 ntTSL 316.54■□□□□ 0.245e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 315.76■□□□□ 0.115e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 TRAPPC12-218ENST00000479897 454 ntTSL 313.04□□□□□ -0.325e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.321e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 TRAPPC12-219ENST00000479955 420 ntTSL 312.25□□□□□ -0.455e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-207ENST00000565851 565 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-208ENST00000566691 601 ntTSL 511.03□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 TRAPPC12-214ENST00000462983 543 ntTSL 49.49□□□□□ -0.895e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-210ENST00000566925 570 ntTSL 49.48□□□□□ -0.891e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 36.81□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.867e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.87e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.097e-7■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 IKBKG-204ENST00000445622 693 ntTSL 512.48□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 20.2
SLTMQ9NWH9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.038e-9■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.428e-9■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.318e-9■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)23.3■■□□□ 1.328e-7■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.88e-7■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.628e-7■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.055e-12■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.524e-6■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.484e-6■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)21.11■□□□□ 0.971e-6■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 HOXB7-203ENST00000567101 528 ntTSL 210.36□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 517.42■□□□□ 0.388e-8■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 RFX3-207ENST00000449190 869 ntTSL 39.54□□□□□ -0.881e-9■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.261e-9■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.291e-9■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 MCF2L-215ENST00000433807 557 ntTSL 413.59□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 528.92■■■□□ 2.224e-7■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.574e-7■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.624e-7■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.014e-6■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 SH3BP2-215ENST00000510074 649 ntTSL 516.31■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 20.1
SLTMQ9NWH9 SH3BP2-219ENST00000511237 517 ntTSL 516.31■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 20.1
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