RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356810.5

RTEL1-202, Transcript of regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RTEL1, Length 1,339 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-202ENST00000356810 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.68■■■■□ 3.62
RTEL1-202ENST00000356810 ABCC9O60706 1549 aa34.01■■■■□ 3.03
RTEL1-202ENST00000356810 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.81■■■■□ 3
RTEL1-202ENST00000356810 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.26■■■□□ 2.75
RTEL1-202ENST00000356810 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.12■■■□□ 2.73
RTEL1-202ENST00000356810 NACADO15069 1562 aa32.02■■■□□ 2.72
RTEL1-202ENST00000356810 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.82■■■□□ 2.68
RTEL1-202ENST00000356810 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.67■■■□□ 2.66
RTEL1-202ENST00000356810 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.56■■■□□ 2.64
RTEL1-202ENST00000356810 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.56■■■□□ 2.64
RTEL1-202ENST00000356810 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.4■■■□□ 2.62
RTEL1-202ENST00000356810 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
RTEL1-202ENST00000356810 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.1■■■□□ 2.57
RTEL1-202ENST00000356810 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.89■■■□□ 2.54
RTEL1-202ENST00000356810 SCRIBQ14160 1630 aa30.82■■■□□ 2.52
RTEL1-202ENST00000356810 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.71■■■□□ 2.51
RTEL1-202ENST00000356810 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.64■■■□□ 2.5
RTEL1-202ENST00000356810 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
RTEL1-202ENST00000356810 NCAPD3P42695 1498 aa29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-202ENST00000356810 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-202ENST00000356810 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-202ENST00000356810 SMARCA4P51532 1647 aa29.4■■■□□ 2.3
RTEL1-202ENST00000356810 SMARCA2P51531 1590 aa29.35■■■□□ 2.29
RTEL1-202ENST00000356810 CUX2O14529 1486 aa29.34■■■□□ 2.29
RTEL1-202ENST00000356810 HMGXB3Q12766 1538 aa29.33■■■□□ 2.29
RTEL1-202ENST00000356810 ERCC6Q03468 1493 aa29.32■■■□□ 2.28
RTEL1-202ENST00000356810 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
RTEL1-202ENST00000356810 NESP48681 1621 aa29.2■■■□□ 2.26
RTEL1-202ENST00000356810 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
RTEL1-202ENST00000356810 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.14■■■□□ 2.26
RTEL1-202ENST00000356810 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.05■■■□□ 2.24
RTEL1-202ENST00000356810 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.91■■■□□ 2.22
RTEL1-202ENST00000356810 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
RTEL1-202ENST00000356810 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.76■■■□□ 2.2
RTEL1-202ENST00000356810 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.75■■■□□ 2.19
RTEL1-202ENST00000356810 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.7■■■□□ 2.18
RTEL1-202ENST00000356810 WIZO95785 1651 aa28.66■■■□□ 2.18
RTEL1-202ENST00000356810 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.52■■■□□ 2.16
RTEL1-202ENST00000356810 WDR62O43379 1518 aa28.48■■■□□ 2.15
RTEL1-202ENST00000356810 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
RTEL1-202ENST00000356810 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.36■■■□□ 2.13
RTEL1-202ENST00000356810 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.36■■■□□ 2.13
RTEL1-202ENST00000356810 CFTRP13569 1480 aa28.35■■■□□ 2.13
RTEL1-202ENST00000356810 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-202ENST00000356810 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
RTEL1-202ENST00000356810 TRIM41Q8WV44 630 aa28.14■■■□□ 2.09
RTEL1-202ENST00000356810 CCDC88BA6NC98 1476 aa28■■■□□ 2.07
RTEL1-202ENST00000356810 OSCARQ8IYS5 282 aa27.99■■■□□ 2.07
RTEL1-202ENST00000356810 PRDM2Q13029 1718 aa27.96■■■□□ 2.07
RTEL1-202ENST00000356810 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
RTEL1-202ENST00000356810 IFT140Q96RY7 1462 aa27.82■■■□□ 2.04
RTEL1-202ENST00000356810 TOPBP1Q92547 1522 aa27.81■■■□□ 2.04
RTEL1-202ENST00000356810 ABCC8Q09428 1581 aa27.69■■■□□ 2.02
RTEL1-202ENST00000356810 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.66■■■□□ 2.02
RTEL1-202ENST00000356810 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.63■■■□□ 2.01
RTEL1-202ENST00000356810 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.63■■■□□ 2.01
RTEL1-202ENST00000356810 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.63■■■□□ 2.01
RTEL1-202ENST00000356810 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
RTEL1-202ENST00000356810 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
RTEL1-202ENST00000356810 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 21e-9■■■■■ 36.4
RTEL1-202ENST00000356810 ARHGEF11O15085 1522 aa27.55■■■□□ 2
RTEL1-202ENST00000356810 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
RTEL1-202ENST00000356810 CHD1O14646 1710 aa27.43■■□□□ 1.98
RTEL1-202ENST00000356810 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.43■■□□□ 1.98
RTEL1-202ENST00000356810 SOGA1O94964 1423 aa27.38■■□□□ 1.97
RTEL1-202ENST00000356810 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-202ENST00000356810 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-202ENST00000356810 FBLN2P98095 1184 aa27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-202ENST00000356810 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-202ENST00000356810 CUX1P39880 1505 aa27.29■■□□□ 1.96
RTEL1-202ENST00000356810 ARAP1Q96P48 1450 aa27.28■■□□□ 1.96
RTEL1-202ENST00000356810 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.25■■□□□ 1.95
RTEL1-202ENST00000356810 WDR97A6NE52 1622 aa27.23■■□□□ 1.95
RTEL1-202ENST00000356810 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-202ENST00000356810 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
RTEL1-202ENST00000356810 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
RTEL1-202ENST00000356810 GRIN2BQ13224 1484 aa27.14■■□□□ 1.94
RTEL1-202ENST00000356810 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
RTEL1-202ENST00000356810 SYNJ2O15056 1496 aa27.07■■□□□ 1.92
RTEL1-202ENST00000356810 SYNJ1O43426 1573 aa27.07■■□□□ 1.92
RTEL1-202ENST00000356810 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
RTEL1-202ENST00000356810 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.04■■□□□ 1.92
RTEL1-202ENST00000356810 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.01■■□□□ 1.91
RTEL1-202ENST00000356810 PBRM1Q86U86 1689 aa26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-202ENST00000356810 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.97■■□□□ 1.91
RTEL1-202ENST00000356810 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
RTEL1-202ENST00000356810 GRIN2AQ12879 1464 aa26.81■■□□□ 1.88
RTEL1-202ENST00000356810 TOP2BQ02880 1626 aa26.78■■□□□ 1.88
RTEL1-202ENST00000356810 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.78■■□□□ 1.88
RTEL1-202ENST00000356810 ADAMTS12P58397 1594 aa26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-202ENST00000356810 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-202ENST00000356810 NUP160Q12769 1436 aa26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-202ENST00000356810 CEP170Q5SW79 1584 aa26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-202ENST00000356810 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.69■■□□□ 1.86
RTEL1-202ENST00000356810 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.65■■□□□ 1.86
RTEL1-202ENST00000356810 SHROOM2Q13796 1616 aa26.63■■□□□ 1.85
RTEL1-202ENST00000356810 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
RTEL1-202ENST00000356810 JPH4Q96JJ6 628 aa26.47■■□□□ 1.83
RTEL1-202ENST00000356810 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.4■■□□□ 1.82
RTEL1-202ENST00000356810 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.2 ms