Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 SH3PXD2A-204ENST00000420222 3251 ntTSL 219.46■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 CHD2-217ENST00000629136 480 ntTSL 517.16■□□□□ 0.341e-9■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 CHD2-207ENST00000626782 2131 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 01e-9■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 CHD2-206ENST00000625990 888 ntTSL 514.32□□□□□ -0.121e-9■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-9■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.191e-9■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 FANCA-206ENST00000561660 762 ntTSL 528.62■■■□□ 2.172e-11■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 FANCA-201ENST00000305699 1430 ntTSL 224.86■■□□□ 1.572e-11■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 FANCA-229ENST00000567988 915 ntTSL 519.39■□□□□ 0.692e-11■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 FANCA-211ENST00000563510 633 ntTSL 517.32■□□□□ 0.362e-11■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.751e-8■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 RAC1-204ENST00000488373 845 ntTSL 1 (best)28.36■■■□□ 2.131e-8■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.991e-8■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 RAC1-206ENST00000497741 651 ntTSL 215.76■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 DAG1-216ENST00000479935 711 ntTSL 1 (best)23.73■■□□□ 1.395e-7■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 PRR4-202ENST00000534923 533 ntTSL 24.44□□□□□ -1.74e-7■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 AP2A2-205ENST00000525796 551 ntTSL 531.19■■■□□ 2.584e-7■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 L3MBTL4-202ENST00000400104 4534 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 30.2
HNRNPMP52272 SYN3-202ENST00000358763 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.642e-7■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 339.9■■■■□ 3.982e-7■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 325.02■■□□□ 1.62e-7■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.176e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.066e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-212ENST00000580322 1558 ntTSL 533.57■■■□□ 2.966e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-213ENST00000580484 686 ntTSL 329.8■■■□□ 2.366e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-226ENST00000584861 579 ntTSL 227.76■■■□□ 2.036e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-201ENST00000293208 1272 ntTSL 527.29■■□□□ 1.966e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-221ENST00000583536 1000 ntTSL 325.82■■□□□ 1.726e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-219ENST00000583170 553 ntTSL 425.82■■□□□ 1.726e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-204ENST00000577292 1097 ntTSL 225.82■■□□□ 1.726e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-205ENST00000578288 870 ntTSL 1 (best)25.68■■□□□ 1.76e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-222ENST00000583737 525 ntTSL 424.05■■□□□ 1.446e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-211ENST00000579877 561 ntTSL 221.34■■□□□ 1.016e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-217ENST00000582022 2409 ntTSL 1 (best)20.19■□□□□ 0.826e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.536e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-203ENST00000542343 1011 ntTSL 216.26■□□□□ 0.196e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 COPG2-202ENST00000425248 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.046e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 JRKL-AS1-201ENST00000511243 426 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.296e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-206ENST00000578354 574 ntTSL 413.09□□□□□ -0.316e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-208ENST00000578909 678 ntTSL 512.96□□□□□ -0.336e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SAP30BP-210ENST00000579864 868 ntTSL 312.46□□□□□ -0.416e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 COPG2-203ENST00000617523 2142 ntTSL 59.63□□□□□ -0.876e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.946e-9■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 WDR70-207ENST00000511906 5716 ntTSL 26.51□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 WDR70-206ENST00000510699 690 ntTSL 54.32□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 SCAP-203ENST00000416208 1222 ntTSL 530.44■■■□□ 2.462e-7■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.156e-7■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 VPS37A-206ENST00000520140 2102 ntTSL 521.8■■□□□ 1.086e-7■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 VPS37A-210ENST00000521829 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 VPS37A-202ENST00000425020 4051 ntTSL 213.47□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 30.1
HNRNPMP52272 PICALM-205ENST00000526548 738 ntTSL 1 (best)5.82□□□□□ -1.488e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 PICALM-211ENST00000529016 757 ntTSL 35.82□□□□□ -1.488e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 PICALM-212ENST00000529760 1153 ntTSL 55.55□□□□□ -1.528e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 PICALM-220ENST00000532603 566 ntTSL 45.4□□□□□ -1.548e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 PICALM-214ENST00000530692 963 ntTSL 54.69□□□□□ -1.668e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 PICALM-207ENST00000526961 802 ntTSL 54.51□□□□□ -1.698e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 EHMT1-249ENST00000637949 575 ntTSL 514.38□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 P4HA1-202ENST00000307116 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 P4HA1-203ENST00000373008 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.298e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 30
HNRNPMP52272 HDLBP-218ENST00000441124 708 ntTSL 230.47■■■□□ 2.474e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 HDLBP-210ENST00000423693 544 ntTSL 520.03■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 HDLBP-246ENST00000496569 374 ntTSL 419.46■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 HDLBP-207ENST00000420451 559 ntTSL 417.28■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 HDLBP-205ENST00000413241 581 ntTSL 516.3■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 HDLBP-216ENST00000428482 1096 ntTSL 516.28■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 HDLBP-206ENST00000417540 525 ntTSL 416.28■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 HDLBP-230ENST00000462130 464 ntTSL 416.23■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 HDLBP-211ENST00000425989 530 ntTSL 514.18□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 DEAF1-210ENST00000529717 705 ntTSL 530.77■■■□□ 2.522e-8■■■■■ 30
HNRNPMP52272 DEAF1-203ENST00000525626 585 ntTSL 321.04■□□□□ 0.962e-8■■■■■ 30
HNRNPMP52272 DEAF1-209ENST00000528864 557 ntTSL 415.71■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 30
HNRNPMP52272 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 540.47■■■■■ 4.079e-9■■■■■ 30
HNRNPMP52272 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.289e-9■■■■■ 30
HNRNPMP52272 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 325.43■■□□□ 1.669e-9■■■■■ 30
HNRNPMP52272 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.279e-9■■■■■ 30
HNRNPMP52272 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.199e-9■■■■■ 30
HNRNPMP52272 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.429e-9■■■■■ 30
HNRNPMP52272 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.389e-9■■■■■ 30
HNRNPMP52272 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.349e-9■■■■■ 30
HNRNPMP52272 ITGB5-207ENST00000481591 1202 ntTSL 529.17■■■□□ 2.264e-7■■■■■ 30
HNRNPMP52272 ZNF148-208ENST00000495019 763 ntTSL 530.05■■■□□ 2.41e-6■■■■■ 30
HNRNPMP52272 HERC2-207ENST00000564734 3121 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 30
HNRNPMP52272 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.048e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.798e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 NDUFAF2-202ENST00000502658 461 ntTSL 1 (best)6.85□□□□□ -1.318e-8■■■■■ 29.9
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 36 ms