Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YY1P25490 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YY1P25490 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YY1P25490 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
YY1P25490 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YY1P25490 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YY1P25490 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YY1P25490 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YY1P25490 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YY1P25490 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YY1P25490 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YY1P25490 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YY1P25490 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YY1P25490 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YY1P25490 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YY1P25490 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YY1P25490 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
YY1P25490 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
YY1P25490 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YY1P25490 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
YY1P25490 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YY1P25490 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
YY1P25490 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.57■■■□□ 2
YY1P25490 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YY1P25490 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
YY1P25490 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
YY1P25490 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.57■■■□□ 2
YY1P25490 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YY1P25490 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YY1P25490 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YY1P25490 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YY1P25490 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YY1P25490 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.56■■■□□ 2
YY1P25490 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YY1P25490 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YY1P25490 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
YY1P25490 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YY1P25490 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YY1P25490 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YY1P25490 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.53■■■□□ 2
YY1P25490 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
YY1P25490 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YY1P25490 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
YY1P25490 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
YY1P25490 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
YY1P25490 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
YY1P25490 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YY1P25490 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YY1P25490 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
YY1P25490 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
YY1P25490 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
YY1P25490 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YY1P25490 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
YY1P25490 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YY1P25490 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YY1P25490 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YY1P25490 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YY1P25490 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YY1P25490 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YY1P25490 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YY1P25490 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YY1P25490 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YY1P25490 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YY1P25490 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YY1P25490 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YY1P25490 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YY1P25490 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YY1P25490 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YY1P25490 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YY1P25490 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YY1P25490 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
YY1P25490 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YY1P25490 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YY1P25490 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YY1P25490 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms