Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NDPQ00604 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NDPQ00604 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NDPQ00604 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms