RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371968.7

LHFPL1-201, Transcript of LHFPL tetraspan subfamily member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHFPL1, Length 1,675 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL1-201ENST00000371968 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.53■■■□□ 2.8
LHFPL1-201ENST00000371968 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.78■■■□□ 2.2
LHFPL1-201ENST00000371968 ABCC9O60706 1549 aa28.14■■■□□ 2.09
LHFPL1-201ENST00000371968 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.19■■□□□ 1.94
LHFPL1-201ENST00000371968 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
LHFPL1-201ENST00000371968 NACADO15069 1562 aa27.08■■□□□ 1.92
LHFPL1-201ENST00000371968 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.06■■□□□ 1.92
LHFPL1-201ENST00000371968 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.97■■□□□ 1.91
LHFPL1-201ENST00000371968 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.9■■□□□ 1.9
LHFPL1-201ENST00000371968 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.43■■□□□ 1.82
LHFPL1-201ENST00000371968 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
LHFPL1-201ENST00000371968 SCRIBQ14160 1630 aa26.31■■□□□ 1.8
LHFPL1-201ENST00000371968 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.29■■□□□ 1.8
LHFPL1-201ENST00000371968 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.96■■□□□ 1.75
LHFPL1-201ENST00000371968 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.82■■□□□ 1.72
LHFPL1-201ENST00000371968 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
LHFPL1-201ENST00000371968 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.43■■□□□ 1.66
LHFPL1-201ENST00000371968 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.38■■□□□ 1.65
LHFPL1-201ENST00000371968 SMARCA4P51532 1647 aa25.19■■□□□ 1.62
LHFPL1-201ENST00000371968 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
LHFPL1-201ENST00000371968 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.09■■□□□ 1.61
LHFPL1-201ENST00000371968 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.07■■□□□ 1.6
LHFPL1-201ENST00000371968 NCAPD3P42695 1498 aa25.04■■□□□ 1.6
LHFPL1-201ENST00000371968 SMARCA2P51531 1590 aa24.99■■□□□ 1.59
LHFPL1-201ENST00000371968 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.95■■□□□ 1.58
LHFPL1-201ENST00000371968 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
LHFPL1-201ENST00000371968 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
LHFPL1-201ENST00000371968 HMGXB3Q12766 1538 aa24.86■■□□□ 1.57
LHFPL1-201ENST00000371968 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
LHFPL1-201ENST00000371968 WIZO95785 1651 aa24.8■■□□□ 1.56
LHFPL1-201ENST00000371968 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
LHFPL1-201ENST00000371968 NESP48681 1621 aa24.4■■□□□ 1.5
LHFPL1-201ENST00000371968 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.32■■□□□ 1.48
LHFPL1-201ENST00000371968 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.29■■□□□ 1.48
LHFPL1-201ENST00000371968 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.29■■□□□ 1.48
LHFPL1-201ENST00000371968 ERCC6Q03468 1493 aa24.21■■□□□ 1.47
LHFPL1-201ENST00000371968 CFTRP13569 1480 aa24.19■■□□□ 1.46
LHFPL1-201ENST00000371968 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.16■■□□□ 1.46
LHFPL1-201ENST00000371968 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.04■■□□□ 1.44
LHFPL1-201ENST00000371968 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.02■■□□□ 1.44
LHFPL1-201ENST00000371968 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.94■■□□□ 1.42
LHFPL1-201ENST00000371968 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
LHFPL1-201ENST00000371968 CUX2O14529 1486 aa23.9■■□□□ 1.42
LHFPL1-201ENST00000371968 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.89■■□□□ 1.42
LHFPL1-201ENST00000371968 PRDM2Q13029 1718 aa23.88■■□□□ 1.41
LHFPL1-201ENST00000371968 WDR62O43379 1518 aa23.81■■□□□ 1.4
LHFPL1-201ENST00000371968 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
LHFPL1-201ENST00000371968 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.7■■□□□ 1.38
LHFPL1-201ENST00000371968 TOPBP1Q92547 1522 aa23.64■■□□□ 1.38
LHFPL1-201ENST00000371968 ABCC8Q09428 1581 aa23.62■■□□□ 1.37
LHFPL1-201ENST00000371968 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.59■■□□□ 1.37
LHFPL1-201ENST00000371968 CUX1P39880 1505 aa23.52■■□□□ 1.36
LHFPL1-201ENST00000371968 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
LHFPL1-201ENST00000371968 TRIM41Q8WV44 630 aa23.45■■□□□ 1.34
LHFPL1-201ENST00000371968 IFT140Q96RY7 1462 aa23.45■■□□□ 1.34
LHFPL1-201ENST00000371968 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
LHFPL1-201ENST00000371968 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.41■■□□□ 1.34
LHFPL1-201ENST00000371968 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.38■■□□□ 1.33
LHFPL1-201ENST00000371968 SOGA1O94964 1423 aa23.38■■□□□ 1.33
LHFPL1-201ENST00000371968 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
LHFPL1-201ENST00000371968 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
LHFPL1-201ENST00000371968 SYNJ1O43426 1573 aa23.34■■□□□ 1.33
LHFPL1-201ENST00000371968 TOP2BQ02880 1626 aa23.32■■□□□ 1.32
LHFPL1-201ENST00000371968 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.29■■□□□ 1.32
LHFPL1-201ENST00000371968 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
LHFPL1-201ENST00000371968 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
LHFPL1-201ENST00000371968 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
LHFPL1-201ENST00000371968 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.19■■□□□ 1.3
LHFPL1-201ENST00000371968 WDR97A6NE52 1622 aa23.16■■□□□ 1.3
LHFPL1-201ENST00000371968 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.12■■□□□ 1.29
LHFPL1-201ENST00000371968 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.1■■□□□ 1.29
LHFPL1-201ENST00000371968 GRIN2BQ13224 1484 aa23.06■■□□□ 1.28
LHFPL1-201ENST00000371968 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.05■■□□□ 1.28
LHFPL1-201ENST00000371968 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.02■■□□□ 1.28
LHFPL1-201ENST00000371968 OSCARQ8IYS5 282 aa23.01■■□□□ 1.27
LHFPL1-201ENST00000371968 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
LHFPL1-201ENST00000371968 FBLN2P98095 1184 aa22.97■■□□□ 1.27
LHFPL1-201ENST00000371968 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
LHFPL1-201ENST00000371968 EEA1Q15075 1411 aa22.96■■□□□ 1.27
LHFPL1-201ENST00000371968 PBRM1Q86U86 1689 aa22.96■■□□□ 1.27
LHFPL1-201ENST00000371968 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LHFPL1-201ENST00000371968 KIF27Q86VH2 1401 aa22.91■■□□□ 1.26
LHFPL1-201ENST00000371968 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.9■■□□□ 1.26
LHFPL1-201ENST00000371968 SYNJ2O15056 1496 aa22.9■■□□□ 1.26
LHFPL1-201ENST00000371968 CHD1O14646 1710 aa22.88■■□□□ 1.25
LHFPL1-201ENST00000371968 IGF1RP08069 1367 aa22.86■■□□□ 1.25
LHFPL1-201ENST00000371968 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.83■■□□□ 1.25
LHFPL1-201ENST00000371968 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.82■■□□□ 1.24
LHFPL1-201ENST00000371968 ADAMTS12P58397 1594 aa22.82■■□□□ 1.24
LHFPL1-201ENST00000371968 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.81■■□□□ 1.24
LHFPL1-201ENST00000371968 GRIN2AQ12879 1464 aa22.77■■□□□ 1.24
LHFPL1-201ENST00000371968 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.74■■□□□ 1.23
LHFPL1-201ENST00000371968 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.7■■□□□ 1.22
LHFPL1-201ENST00000371968 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.68■■□□□ 1.22
LHFPL1-201ENST00000371968 NUP160Q12769 1436 aa22.68■■□□□ 1.22
LHFPL1-201ENST00000371968 CUL7Q14999 1698 aa22.67■■□□□ 1.22
LHFPL1-201ENST00000371968 CEP170Q5SW79 1584 aa22.65■■□□□ 1.22
LHFPL1-201ENST00000371968 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.62■■□□□ 1.21
LHFPL1-201ENST00000371968 KIF21BO75037 1637 aa22.61■■□□□ 1.21
LHFPL1-201ENST00000371968 GOLGA3Q08378 1498 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms