Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NDPQ00604 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NDPQ00604 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NDPQ00604 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDPQ00604 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDPQ00604 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDPQ00604 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDPQ00604 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDPQ00604 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDPQ00604 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDPQ00604 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDPQ00604 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDPQ00604 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDPQ00604 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDPQ00604 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDPQ00604 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDPQ00604 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDPQ00604 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDPQ00604 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDPQ00604 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDPQ00604 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDPQ00604 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDPQ00604 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDPQ00604 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDPQ00604 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDPQ00604 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDPQ00604 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDPQ00604 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDPQ00604 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDPQ00604 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDPQ00604 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDPQ00604 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDPQ00604 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDPQ00604 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDPQ00604 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDPQ00604 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDPQ00604 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDPQ00604 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDPQ00604 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDPQ00604 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDPQ00604 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDPQ00604 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDPQ00604 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDPQ00604 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDPQ00604 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDPQ00604 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDPQ00604 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDPQ00604 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDPQ00604 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDPQ00604 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDPQ00604 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDPQ00604 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDPQ00604 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDPQ00604 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDPQ00604 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDPQ00604 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NDPQ00604 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDPQ00604 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDPQ00604 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDPQ00604 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDPQ00604 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDPQ00604 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDPQ00604 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDPQ00604 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDPQ00604 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDPQ00604 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDPQ00604 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDPQ00604 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDPQ00604 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDPQ00604 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDPQ00604 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDPQ00604 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDPQ00604 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDPQ00604 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDPQ00604 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDPQ00604 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDPQ00604 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDPQ00604 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDPQ00604 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDPQ00604 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDPQ00604 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDPQ00604 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NDPQ00604 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDPQ00604 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDPQ00604 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDPQ00604 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDPQ00604 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NDPQ00604 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDPQ00604 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDPQ00604 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDPQ00604 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDPQ00604 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDPQ00604 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDPQ00604 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NDPQ00604 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDPQ00604 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDPQ00604 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDPQ00604 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDPQ00604 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDPQ00604 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms