RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227520.9

CCDC86-201, Transcript of coiled-coil domain containing 86, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC86, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86-201ENST00000227520 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.71■■■□□ 2.83
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CCDC86-201ENST00000227520 SMARCA2P51531 1590 aa25.17■■□□□ 1.62
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CCDC86-201ENST00000227520 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.36■■□□□ 1.49
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CCDC86-201ENST00000227520 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.28■■□□□ 1.48
CCDC86-201ENST00000227520 PRDM2Q13029 1718 aa24.27■■□□□ 1.48
CCDC86-201ENST00000227520 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CCDC86-201ENST00000227520 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.16■■□□□ 1.46
CCDC86-201ENST00000227520 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC86-201ENST00000227520 CUX2O14529 1486 aa24.11■■□□□ 1.45
CCDC86-201ENST00000227520 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC86-201ENST00000227520 WDR62O43379 1518 aa24.03■■□□□ 1.44
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CCDC86-201ENST00000227520 TOPBP1Q92547 1522 aa23.8■■□□□ 1.4
CCDC86-201ENST00000227520 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.8■■□□□ 1.4
CCDC86-201ENST00000227520 ABCC8Q09428 1581 aa23.74■■□□□ 1.39
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CCDC86-201ENST00000227520 IFT140Q96RY7 1462 aa23.59■■□□□ 1.37
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CCDC86-201ENST00000227520 SYNJ1O43426 1573 aa23.53■■□□□ 1.36
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CCDC86-201ENST00000227520 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.51■■□□□ 1.35
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CCDC86-201ENST00000227520 TOP2BQ02880 1626 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC86-201ENST00000227520 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CCDC86-201ENST00000227520 WDR97A6NE52 1622 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC86-201ENST00000227520 SOGA1O94964 1423 aa23.45■■□□□ 1.35
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CCDC86-201ENST00000227520 PBRM1Q86U86 1689 aa23.28■■□□□ 1.32
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CCDC86-201ENST00000227520 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.21■■□□□ 1.31
CCDC86-201ENST00000227520 CHD1O14646 1710 aa23.21■■□□□ 1.31
CCDC86-201ENST00000227520 GRIN2BQ13224 1484 aa23.19■■□□□ 1.3
CCDC86-201ENST00000227520 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.19■■□□□ 1.3
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CCDC86-201ENST00000227520 ADAMTS12P58397 1594 aa23.06■■□□□ 1.28
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CCDC86-201ENST00000227520 OSCARQ8IYS5 282 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC86-201ENST00000227520 SYNJ2O15056 1496 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC86-201ENST00000227520 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC86-201ENST00000227520 FBLN2P98095 1184 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC86-201ENST00000227520 KIF27Q86VH2 1401 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC86-201ENST00000227520 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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CCDC86-201ENST00000227520 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.93■■□□□ 1.26
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CCDC86-201ENST00000227520 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.87■■□□□ 1.25
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CCDC86-201ENST00000227520 HRCP23327 699 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC86-201ENST00000227520 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC86-201ENST00000227520 CEP170Q5SW79 1584 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC86-201ENST00000227520 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC86-201ENST00000227520 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC86-201ENST00000227520 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC86-201ENST00000227520 NUP160Q12769 1436 aa22.8■■□□□ 1.24
CCDC86-201ENST00000227520 ARHGEF11O15085 1522 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC86-201ENST00000227520 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.74■■□□□ 1.23
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