RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259983.7

C6orf52-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 52, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene C6orf52, Length 619 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf52-201ENST00000259983 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.66■■■■□ 3.3
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C6orf52-201ENST00000259983 SCRIBQ14160 1630 aa29.04■■■□□ 2.24
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C6orf52-201ENST00000259983 SMARCA2P51531 1590 aa27.73■■■□□ 2.03
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C6orf52-201ENST00000259983 CFTRP13569 1480 aa26.75■■□□□ 1.87
C6orf52-201ENST00000259983 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.7■■□□□ 1.87
C6orf52-201ENST00000259983 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.68■■□□□ 1.86
C6orf52-201ENST00000259983 PRDM2Q13029 1718 aa26.5■■□□□ 1.83
C6orf52-201ENST00000259983 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.48■■□□□ 1.83
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C6orf52-201ENST00000259983 TOPBP1Q92547 1522 aa26.2■■□□□ 1.79
C6orf52-201ENST00000259983 IFT140Q96RY7 1462 aa26.18■■□□□ 1.78
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C6orf52-201ENST00000259983 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.78■■□□□ 1.72
C6orf52-201ENST00000259983 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.75■■□□□ 1.71
C6orf52-201ENST00000259983 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.75■■□□□ 1.71
C6orf52-201ENST00000259983 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.75■■□□□ 1.71
C6orf52-201ENST00000259983 CHD1O14646 1710 aa25.73■■□□□ 1.71
C6orf52-201ENST00000259983 ARHGEF11O15085 1522 aa25.71■■□□□ 1.71
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C6orf52-201ENST00000259983 FBLN2P98095 1184 aa25.58■■□□□ 1.69
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C6orf52-201ENST00000259983 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.49■■□□□ 1.67
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C6orf52-201ENST00000259983 ARAP1Q96P48 1450 aa25.46■■□□□ 1.67
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C6orf52-201ENST00000259983 NUP160Q12769 1436 aa25.2■■□□□ 1.63
C6orf52-201ENST00000259983 CEP170Q5SW79 1584 aa25.14■■□□□ 1.62
C6orf52-201ENST00000259983 SHROOM2Q13796 1616 aa25.08■■□□□ 1.61
C6orf52-201ENST00000259983 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
C6orf52-201ENST00000259983 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.03■■□□□ 1.6
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C6orf52-201ENST00000259983 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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