Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASIC1P78348 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms