Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 322.84■■□□□ 1.252e-6■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 12e-6■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 18.9
AATFQ9NY61 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.458e-11■■■□□ 18.8
AATFQ9NY61 TSC1-206ENST00000490179 681 ntTSL 317.74■□□□□ 0.438e-11■■■□□ 18.8
AATFQ9NY61 TSC1-205ENST00000475903 820 ntTSL 417.68■□□□□ 0.428e-11■■■□□ 18.8
AATFQ9NY61 TSC1-207ENST00000493467 2219 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.648e-11■■■□□ 18.8
AATFQ9NY61 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.148e-11■■■□□ 18.8
AATFQ9NY61 GAS5-207ENST00000422207 643 ntTSL 26.83□□□□□ -1.322e-78■■■□□ 18.7
AATFQ9NY61 GAS5-217ENST00000444470 424 ntTSL 26.83□□□□□ -1.322e-78■■■□□ 18.7
AATFQ9NY61 GAS5-212ENST00000434796 575 ntTSL 20.86□□□□□ -2.272e-78■■■□□ 18.7
AATFQ9NY61 SNHG1-201ENST00000535076 849 ntTSL 25.7□□□□□ -1.51e-323■■■□□ 18.6
AATFQ9NY61 RPL3-203ENST00000402527 1205 ntTSL 522.09■■□□□ 1.131e-323■■■□□ 18.6
AATFQ9NY61 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.121e-323■■■□□ 18.6
AATFQ9NY61 RPL3-211ENST00000465618 2108 ntTSL 1 (best)17.26■□□□□ 0.351e-323■■■□□ 18.6
AATFQ9NY61 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.86e-8■■■□□ 18.6
AATFQ9NY61 RABL6-206ENST00000436380 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.14■□□□□ 0.331e-7■■■□□ 18.6
AATFQ9NY61 SNORA5C-201ENST00000364902 137 ntBASIC12.73□□□□□ -0.374e-89■■■□□ 18.5
AATFQ9NY61 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.769e-6■■■□□ 18.5
AATFQ9NY61 UNKL-214ENST00000515195 481 ntTSL 418.4■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 18.4
AATFQ9NY61 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.312e-22■■■□□ 18.4
AATFQ9NY61 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.345e-7■■■□□ 18.3
AATFQ9NY61 BCL7A-202ENST00000432926 871 ntTSL 228.07■■■□□ 2.081e-8■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.351e-8■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.961e-8■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PUM1-220ENST00000529846 683 ntTSL 36.35□□□□□ -1.391e-8■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PUM1-216ENST00000525997 650 ntTSL 36.27□□□□□ -1.411e-8■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PUM1-219ENST00000527498 652 ntTSL 34.16□□□□□ -1.741e-8■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 GUK1-218ENST00000469973 795 ntTSL 231.5■■■□□ 2.633e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 AC004980.1-202ENST00000450661 962 ntTSL 1 (best)29.29■■■□□ 2.283e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 AC004980.1-203ENST00000423084 748 ntTSL 327.99■■■□□ 2.073e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SNIP1-203ENST00000493916 546 ntTSL 427.56■■■□□ 23e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 226.23■■□□□ 1.792e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.762e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 DDHD2-203ENST00000519857 1668 ntTSL 225.71■■□□□ 1.713e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-221ENST00000523131 567 ntTSL 525.22■■□□□ 1.633e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 525.15■■□□□ 1.623e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.573e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-208ENST00000418997 996 ntTSL 224.69■■□□□ 1.543e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 DDHD2-214ENST00000528358 600 ntTSL 424.58■■□□□ 1.533e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.493e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.493e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.483e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-223ENST00000523938 626 ntTSL 524.3■■□□□ 1.483e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.472e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 BTNL9-205ENST00000509395 611 ntTSL 423.94■■□□□ 1.422e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)23.74■■□□□ 1.393e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.46■■□□□ 1.353e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-210ENST00000437293 701 ntTSL 323.43■■□□□ 1.343e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.299e-9■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.222e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TMEM161B-AS1-203ENST00000501869 684 ntTSL 1 (best)22.54■■□□□ 1.23e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 DDHD2-209ENST00000526237 697 ntTSL 522.52■■□□□ 1.23e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.192e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 BTNL9-207ENST00000511589 571 ntTSL 422.34■■□□□ 1.172e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 BTNL9-206ENST00000511056 332 ntTSL 322.34■■□□□ 1.172e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 KCNH2-204ENST00000461280 2430 ntTSL 1 (best)22.07■■□□□ 1.129e-9■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.119e-9■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-215ENST00000518736 883 ntTSL 321.94■■□□□ 1.13e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.993e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.992e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.962e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 KCNH2-206ENST00000532957 3374 ntTSL 220.97■□□□□ 0.959e-9■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.949e-9■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 ARID4B-204ENST00000418304 1759 ntTSL 520.91■□□□□ 0.942e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 KCNH2-205ENST00000473610 2782 ntTSL 220.45■□□□□ 0.869e-9■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 DDHD2-210ENST00000526370 575 ntTSL 420.37■□□□□ 0.853e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.843e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 ARID4B-208ENST00000466653 2315 ntTSL 219.95■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.773e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.772e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.753e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TMEM161B-AS1-205ENST00000504769 548 ntTSL 419.75■□□□□ 0.753e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 DDHD2-224ENST00000533100 683 ntTSL 519.27■□□□□ 0.683e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 BTNL9-203ENST00000491209 2199 ntTSL 218.92■□□□□ 0.622e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.613e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.62e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TMEM161B-AS1-206ENST00000504922 585 ntTSL 218.73■□□□□ 0.593e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.572e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.573e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.533e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.532e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SNIP1-202ENST00000468040 931 ntTSL 518.31■□□□□ 0.523e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.522e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SURF4-201ENST00000371982 553 ntTSL 318.2■□□□□ 0.52e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.463e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 ARID4B-207ENST00000462969 273 ntTSL 217.72■□□□□ 0.432e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TMEM161B-AS1-210ENST00000510087 590 ntTSL 317.54■□□□□ 0.43e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.43e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-206ENST00000445745 2570 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.372e-7■■■□□ 18.2
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