Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms