Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.133e-7■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.143e-7■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-7■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 ABCA2-218ENST00000487109 8031 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.313e-7■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 ABCA2-208ENST00000459850 8073 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.313e-7■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-8■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 213.93□□□□□ -0.181e-8■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.021e-8■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 XPO1-209ENST00000443240 565 ntTSL 44.84□□□□□ -1.631e-8■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 XPO1-207ENST00000436018 318 ntTSL 44.13□□□□□ -1.751e-8■■■■□ 25.6
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PRPF4O43172 HNRNPH1-238ENST00000521116 806 ntTSL 420.55■□□□□ 0.885e-10■■■■□ 25.6
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PRPF4O43172 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -05e-10■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 HNRNPH1-225ENST00000515158 850 ntTSL 414.86□□□□□ -0.035e-10■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 HNRNPH1-226ENST00000515446 368 ntTSL 214.39□□□□□ -0.115e-10■■■■□ 25.6
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PRPF4O43172 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.225e-10■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 HNRNPH1-220ENST00000513225 805 ntTSL 413.53□□□□□ -0.245e-10■■■■□ 25.6
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PRPF4O43172 HNRNPH1-211ENST00000504779 792 ntTSL 512.69□□□□□ -0.385e-10■■■■□ 25.6
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PRPF4O43172 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 EIF6-208ENST00000462894 453 ntTSL 324.72■■□□□ 1.551e-20■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-20■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.861e-20■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 EIF6-207ENST00000456600 551 ntTSL 320.42■□□□□ 0.861e-20■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 EIF6-204ENST00000415116 739 ntTSL 519.85■□□□□ 0.771e-20■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.321e-20■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 EIF6-206ENST00000447927 932 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.071e-20■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.021e-20■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CDK5RAP2-212ENST00000480112 5826 ntTSL 1 (best)13.34□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.812e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)8.32□□□□□ -1.082e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.792e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.692e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CCDC61-206ENST00000596687 800 ntTSL 523.77■■□□□ 1.42e-7■■■■□ 25.5
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