Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQC6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQC6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQC6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQC6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms