Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAD54BQ9Y620 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAD54BQ9Y620 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAD54BQ9Y620 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAD54BQ9Y620 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAD54BQ9Y620 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD54BQ9Y620 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAD54BQ9Y620 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RAD54BQ9Y620 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD54BQ9Y620 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD54BQ9Y620 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD54BQ9Y620 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD54BQ9Y620 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD54BQ9Y620 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RAD54BQ9Y620 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RAD54BQ9Y620 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD54BQ9Y620 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD54BQ9Y620 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD54BQ9Y620 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD54BQ9Y620 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD54BQ9Y620 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD54BQ9Y620 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD54BQ9Y620 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD54BQ9Y620 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAD54BQ9Y620 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD54BQ9Y620 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD54BQ9Y620 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD54BQ9Y620 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD54BQ9Y620 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD54BQ9Y620 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD54BQ9Y620 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD54BQ9Y620 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD54BQ9Y620 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD54BQ9Y620 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD54BQ9Y620 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD54BQ9Y620 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD54BQ9Y620 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD54BQ9Y620 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RAD54BQ9Y620 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD54BQ9Y620 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD54BQ9Y620 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54BQ9Y620 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54BQ9Y620 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54BQ9Y620 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54BQ9Y620 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54BQ9Y620 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54BQ9Y620 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54BQ9Y620 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54BQ9Y620 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54BQ9Y620 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54BQ9Y620 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms