Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F3

PCDHB1, Protocadherin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB1Q9Y5F3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB1Q9Y5F3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB1Q9Y5F3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB1Q9Y5F3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB1Q9Y5F3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB1Q9Y5F3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB1Q9Y5F3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB1Q9Y5F3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB1Q9Y5F3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB1Q9Y5F3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB1Q9Y5F3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB1Q9Y5F3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB1Q9Y5F3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB1Q9Y5F3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB1Q9Y5F3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB1Q9Y5F3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB1Q9Y5F3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB1Q9Y5F3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB1Q9Y5F3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB1Q9Y5F3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB1Q9Y5F3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB1Q9Y5F3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB1Q9Y5F3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB1Q9Y5F3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB1Q9Y5F3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB1Q9Y5F3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB1Q9Y5F3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB1Q9Y5F3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB1Q9Y5F3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB1Q9Y5F3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB1Q9Y5F3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB1Q9Y5F3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB1Q9Y5F3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB1Q9Y5F3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB1Q9Y5F3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB1Q9Y5F3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB1Q9Y5F3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB1Q9Y5F3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB1Q9Y5F3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB1Q9Y5F3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB1Q9Y5F3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB1Q9Y5F3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB1Q9Y5F3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB1Q9Y5F3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms