Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
KDM2AQ9Y2K7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
KDM2AQ9Y2K7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
KDM2AQ9Y2K7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
KDM2AQ9Y2K7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.03
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM2AQ9Y2K7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM2AQ9Y2K7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
KDM2AQ9Y2K7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM2AQ9Y2K7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
KDM2AQ9Y2K7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
KDM2AQ9Y2K7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KDM2AQ9Y2K7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KDM2AQ9Y2K7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM2AQ9Y2K7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.01■■■■■ 4
KDM2AQ9Y2K7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40■■■■□ 3.99
KDM2AQ9Y2K7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
KDM2AQ9Y2K7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KDM2AQ9Y2K7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
KDM2AQ9Y2K7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM2AQ9Y2K7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM2AQ9Y2K7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM2AQ9Y2K7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM2AQ9Y2K7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM2AQ9Y2K7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM2AQ9Y2K7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
KDM2AQ9Y2K7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
KDM2AQ9Y2K7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
KDM2AQ9Y2K7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM2AQ9Y2K7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM2AQ9Y2K7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM2AQ9Y2K7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM2AQ9Y2K7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM2AQ9Y2K7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
KDM2AQ9Y2K7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM2AQ9Y2K7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
KDM2AQ9Y2K7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
KDM2AQ9Y2K7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
KDM2AQ9Y2K7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KDM2AQ9Y2K7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
KDM2AQ9Y2K7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
KDM2AQ9Y2K7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM2AQ9Y2K7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM2AQ9Y2K7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM2AQ9Y2K7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
KDM2AQ9Y2K7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM2AQ9Y2K7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
KDM2AQ9Y2K7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
KDM2AQ9Y2K7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
KDM2AQ9Y2K7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
KDM2AQ9Y2K7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
KDM2AQ9Y2K7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
KDM2AQ9Y2K7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
KDM2AQ9Y2K7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM2AQ9Y2K7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
KDM2AQ9Y2K7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM2AQ9Y2K7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
KDM2AQ9Y2K7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
KDM2AQ9Y2K7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
KDM2AQ9Y2K7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM2AQ9Y2K7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM2AQ9Y2K7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM2AQ9Y2K7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
KDM2AQ9Y2K7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
KDM2AQ9Y2K7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
KDM2AQ9Y2K7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM2AQ9Y2K7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
KDM2AQ9Y2K7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
KDM2AQ9Y2K7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
KDM2AQ9Y2K7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM2AQ9Y2K7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM2AQ9Y2K7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM2AQ9Y2K7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM2AQ9Y2K7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM2AQ9Y2K7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM2AQ9Y2K7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM2AQ9Y2K7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM2AQ9Y2K7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
KDM2AQ9Y2K7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
KDM2AQ9Y2K7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
KDM2AQ9Y2K7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
KDM2AQ9Y2K7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
KDM2AQ9Y2K7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM2AQ9Y2K7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM2AQ9Y2K7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM2AQ9Y2K7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM2AQ9Y2K7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KDM2AQ9Y2K7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
KDM2AQ9Y2K7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
KDM2AQ9Y2K7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
KDM2AQ9Y2K7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
KDM2AQ9Y2K7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM2AQ9Y2K7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM2AQ9Y2K7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
KDM2AQ9Y2K7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
KDM2AQ9Y2K7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms