Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCML1Q9UN30 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCML1Q9UN30 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCML1Q9UN30 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCML1Q9UN30 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCML1Q9UN30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCML1Q9UN30 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCML1Q9UN30 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCML1Q9UN30 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SCML1Q9UN30 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCML1Q9UN30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCML1Q9UN30 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCML1Q9UN30 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCML1Q9UN30 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCML1Q9UN30 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCML1Q9UN30 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCML1Q9UN30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCML1Q9UN30 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCML1Q9UN30 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCML1Q9UN30 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCML1Q9UN30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCML1Q9UN30 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCML1Q9UN30 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCML1Q9UN30 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCML1Q9UN30 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCML1Q9UN30 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCML1Q9UN30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCML1Q9UN30 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCML1Q9UN30 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCML1Q9UN30 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCML1Q9UN30 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCML1Q9UN30 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCML1Q9UN30 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCML1Q9UN30 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCML1Q9UN30 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCML1Q9UN30 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCML1Q9UN30 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCML1Q9UN30 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCML1Q9UN30 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCML1Q9UN30 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCML1Q9UN30 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCML1Q9UN30 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCML1Q9UN30 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCML1Q9UN30 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCML1Q9UN30 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCML1Q9UN30 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCML1Q9UN30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCML1Q9UN30 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCML1Q9UN30 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCML1Q9UN30 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCML1Q9UN30 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms