Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI0

ATAD2B, ATPase family AAA domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2BQ9ULI0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC51.59■■■■■ 5.85
ATAD2BQ9ULI0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.57■■■■■ 5.85
ATAD2BQ9ULI0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
ATAD2BQ9ULI0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.54■■■■■ 5.84
ATAD2BQ9ULI0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC51.45■■■■■ 5.83
ATAD2BQ9ULI0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
ATAD2BQ9ULI0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC51.39■■■■■ 5.82
ATAD2BQ9ULI0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
ATAD2BQ9ULI0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
ATAD2BQ9ULI0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC51.36■■■■■ 5.81
ATAD2BQ9ULI0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC51.36■■■■■ 5.81
ATAD2BQ9ULI0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC51.35■■■■■ 5.81
ATAD2BQ9ULI0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
ATAD2BQ9ULI0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC51.33■■■■■ 5.81
ATAD2BQ9ULI0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
ATAD2BQ9ULI0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
ATAD2BQ9ULI0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC51.26■■■■■ 5.8
ATAD2BQ9ULI0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC51.26■■■■■ 5.8
ATAD2BQ9ULI0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC51.25■■■■■ 5.8
ATAD2BQ9ULI0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
ATAD2BQ9ULI0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC51.24■■■■■ 5.79
ATAD2BQ9ULI0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.23■■■■■ 5.79
ATAD2BQ9ULI0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC51.22■■■■■ 5.79
ATAD2BQ9ULI0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC51.21■■■■■ 5.79
ATAD2BQ9ULI0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC51.2■■■■■ 5.79
ATAD2BQ9ULI0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
ATAD2BQ9ULI0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.12■■■■■ 5.77
ATAD2BQ9ULI0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
ATAD2BQ9ULI0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.1■■■■■ 5.77
ATAD2BQ9ULI0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC51.1■■■■■ 5.77
ATAD2BQ9ULI0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
ATAD2BQ9ULI0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.01■■■■■ 5.76
ATAD2BQ9ULI0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC51■■■■■ 5.75
ATAD2BQ9ULI0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC51■■■■■ 5.75
ATAD2BQ9ULI0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC50.99■■■■■ 5.75
ATAD2BQ9ULI0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC50.97■■■■■ 5.75
ATAD2BQ9ULI0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC50.92■■■■■ 5.74
ATAD2BQ9ULI0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC50.91■■■■■ 5.74
ATAD2BQ9ULI0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
ATAD2BQ9ULI0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
ATAD2BQ9ULI0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC50.89■■■■■ 5.74
ATAD2BQ9ULI0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
ATAD2BQ9ULI0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.84■■■■■ 5.73
ATAD2BQ9ULI0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC50.84■■■■■ 5.73
ATAD2BQ9ULI0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC50.83■■■■■ 5.73
ATAD2BQ9ULI0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.82■■■■■ 5.73
ATAD2BQ9ULI0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.82■■■■■ 5.73
ATAD2BQ9ULI0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC50.81■■■■■ 5.72
ATAD2BQ9ULI0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC50.81■■■■■ 5.72
ATAD2BQ9ULI0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
ATAD2BQ9ULI0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
ATAD2BQ9ULI0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC50.78■■■■■ 5.72
ATAD2BQ9ULI0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
ATAD2BQ9ULI0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC50.76■■■■■ 5.72
ATAD2BQ9ULI0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC50.75■■■■■ 5.72
ATAD2BQ9ULI0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
ATAD2BQ9ULI0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
ATAD2BQ9ULI0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC50.67■■■■■ 5.7
ATAD2BQ9ULI0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
ATAD2BQ9ULI0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
ATAD2BQ9ULI0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.69
ATAD2BQ9ULI0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
ATAD2BQ9ULI0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
ATAD2BQ9ULI0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
ATAD2BQ9ULI0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC50.54■■■■■ 5.68
ATAD2BQ9ULI0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
ATAD2BQ9ULI0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC50.52■■■■■ 5.68
ATAD2BQ9ULI0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
ATAD2BQ9ULI0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC50.51■■■■■ 5.68
ATAD2BQ9ULI0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC50.51■■■■■ 5.68
ATAD2BQ9ULI0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC50.51■■■■■ 5.68
ATAD2BQ9ULI0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC50.46■■■■■ 5.67
ATAD2BQ9ULI0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC50.46■■■■■ 5.67
ATAD2BQ9ULI0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
ATAD2BQ9ULI0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC50.44■■■■■ 5.66
ATAD2BQ9ULI0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC50.43■■■■■ 5.66
ATAD2BQ9ULI0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
ATAD2BQ9ULI0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
ATAD2BQ9ULI0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC50.38■■■■■ 5.66
ATAD2BQ9ULI0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
ATAD2BQ9ULI0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
ATAD2BQ9ULI0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
ATAD2BQ9ULI0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
ATAD2BQ9ULI0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
ATAD2BQ9ULI0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
ATAD2BQ9ULI0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC50.31■■■■■ 5.64
ATAD2BQ9ULI0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC50.29■■■■■ 5.64
ATAD2BQ9ULI0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
ATAD2BQ9ULI0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
ATAD2BQ9ULI0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC50.26■■■■■ 5.64
ATAD2BQ9ULI0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
ATAD2BQ9ULI0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.22■■■■■ 5.63
ATAD2BQ9ULI0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.62
ATAD2BQ9ULI0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
ATAD2BQ9ULI0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
ATAD2BQ9ULI0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.16■■■■■ 5.62
ATAD2BQ9ULI0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
ATAD2BQ9ULI0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC50.14■■■■■ 5.62
ATAD2BQ9ULI0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
ATAD2BQ9ULI0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms