Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV3

ACIN1, Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACIN1Q9UKV3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ACIN1Q9UKV3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ACIN1Q9UKV3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
ACIN1Q9UKV3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ACIN1Q9UKV3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ACIN1Q9UKV3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ACIN1Q9UKV3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ACIN1Q9UKV3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ACIN1Q9UKV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ACIN1Q9UKV3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ACIN1Q9UKV3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
ACIN1Q9UKV3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ACIN1Q9UKV3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ACIN1Q9UKV3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ACIN1Q9UKV3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ACIN1Q9UKV3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ACIN1Q9UKV3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ACIN1Q9UKV3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ACIN1Q9UKV3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ACIN1Q9UKV3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
ACIN1Q9UKV3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
ACIN1Q9UKV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ACIN1Q9UKV3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ACIN1Q9UKV3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ACIN1Q9UKV3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ACIN1Q9UKV3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ACIN1Q9UKV3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ACIN1Q9UKV3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ACIN1Q9UKV3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ACIN1Q9UKV3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ACIN1Q9UKV3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ACIN1Q9UKV3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ACIN1Q9UKV3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ACIN1Q9UKV3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ACIN1Q9UKV3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
ACIN1Q9UKV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ACIN1Q9UKV3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ACIN1Q9UKV3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ACIN1Q9UKV3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ACIN1Q9UKV3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ACIN1Q9UKV3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ACIN1Q9UKV3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ACIN1Q9UKV3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ACIN1Q9UKV3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ACIN1Q9UKV3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ACIN1Q9UKV3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ACIN1Q9UKV3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ACIN1Q9UKV3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ACIN1Q9UKV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ACIN1Q9UKV3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ACIN1Q9UKV3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ACIN1Q9UKV3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ACIN1Q9UKV3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
ACIN1Q9UKV3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ACIN1Q9UKV3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ACIN1Q9UKV3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ACIN1Q9UKV3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ACIN1Q9UKV3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ACIN1Q9UKV3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ACIN1Q9UKV3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ACIN1Q9UKV3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ACIN1Q9UKV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.69■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.11
ACIN1Q9UKV3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ACIN1Q9UKV3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ACIN1Q9UKV3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ACIN1Q9UKV3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
ACIN1Q9UKV3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ACIN1Q9UKV3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms