Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GMEB2Q9UKD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GMEB2Q9UKD1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GMEB2Q9UKD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GMEB2Q9UKD1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GMEB2Q9UKD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GMEB2Q9UKD1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GMEB2Q9UKD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GMEB2Q9UKD1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GMEB2Q9UKD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GMEB2Q9UKD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GMEB2Q9UKD1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GMEB2Q9UKD1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GMEB2Q9UKD1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GMEB2Q9UKD1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms