Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTNNA3Q9UI47 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTNNA3Q9UI47 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CTNNA3Q9UI47 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTNNA3Q9UI47 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTNNA3Q9UI47 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CTNNA3Q9UI47 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CTNNA3Q9UI47 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CTNNA3Q9UI47 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CTNNA3Q9UI47 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CTNNA3Q9UI47 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CTNNA3Q9UI47 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CTNNA3Q9UI47 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CTNNA3Q9UI47 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CTNNA3Q9UI47 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CTNNA3Q9UI47 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CTNNA3Q9UI47 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CTNNA3Q9UI47 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CTNNA3Q9UI47 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CTNNA3Q9UI47 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CTNNA3Q9UI47 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CTNNA3Q9UI47 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CTNNA3Q9UI47 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CTNNA3Q9UI47 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CTNNA3Q9UI47 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CTNNA3Q9UI47 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CTNNA3Q9UI47 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CTNNA3Q9UI47 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CTNNA3Q9UI47 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CTNNA3Q9UI47 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CTNNA3Q9UI47 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTNNA3Q9UI47 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CTNNA3Q9UI47 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTNNA3Q9UI47 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTNNA3Q9UI47 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTNNA3Q9UI47 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTNNA3Q9UI47 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CTNNA3Q9UI47 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CTNNA3Q9UI47 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CTNNA3Q9UI47 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CTNNA3Q9UI47 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CTNNA3Q9UI47 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CTNNA3Q9UI47 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CTNNA3Q9UI47 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CTNNA3Q9UI47 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CTNNA3Q9UI47 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CTNNA3Q9UI47 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CTNNA3Q9UI47 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CTNNA3Q9UI47 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTNNA3Q9UI47 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTNNA3Q9UI47 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CTNNA3Q9UI47 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CTNNA3Q9UI47 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CTNNA3Q9UI47 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CTNNA3Q9UI47 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms