Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPB1Q9UBR1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPB1Q9UBR1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPB1Q9UBR1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPB1Q9UBR1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPB1Q9UBR1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPB1Q9UBR1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPB1Q9UBR1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPB1Q9UBR1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPB1Q9UBR1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPB1Q9UBR1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPB1Q9UBR1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPB1Q9UBR1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPB1Q9UBR1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPB1Q9UBR1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPB1Q9UBR1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPB1Q9UBR1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPB1Q9UBR1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPB1Q9UBR1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPB1Q9UBR1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPB1Q9UBR1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPB1Q9UBR1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPB1Q9UBR1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPB1Q9UBR1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UPB1Q9UBR1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPB1Q9UBR1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPB1Q9UBR1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPB1Q9UBR1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPB1Q9UBR1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPB1Q9UBR1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPB1Q9UBR1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPB1Q9UBR1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPB1Q9UBR1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPB1Q9UBR1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPB1Q9UBR1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPB1Q9UBR1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPB1Q9UBR1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPB1Q9UBR1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms