Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UPB1Q9UBR1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UPB1Q9UBR1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPB1Q9UBR1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPB1Q9UBR1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
UPB1Q9UBR1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPB1Q9UBR1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPB1Q9UBR1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPB1Q9UBR1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPB1Q9UBR1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPB1Q9UBR1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPB1Q9UBR1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPB1Q9UBR1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UPB1Q9UBR1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UPB1Q9UBR1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPB1Q9UBR1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPB1Q9UBR1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPB1Q9UBR1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPB1Q9UBR1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPB1Q9UBR1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPB1Q9UBR1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPB1Q9UBR1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UPB1Q9UBR1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPB1Q9UBR1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPB1Q9UBR1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPB1Q9UBR1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPB1Q9UBR1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UPB1Q9UBR1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPB1Q9UBR1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPB1Q9UBR1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPB1Q9UBR1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPB1Q9UBR1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPB1Q9UBR1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPB1Q9UBR1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPB1Q9UBR1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UPB1Q9UBR1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPB1Q9UBR1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPB1Q9UBR1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPB1Q9UBR1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
UPB1Q9UBR1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPB1Q9UBR1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPB1Q9UBR1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPB1Q9UBR1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPB1Q9UBR1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPB1Q9UBR1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPB1Q9UBR1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPB1Q9UBR1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPB1Q9UBR1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPB1Q9UBR1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPB1Q9UBR1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPB1Q9UBR1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPB1Q9UBR1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPB1Q9UBR1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPB1Q9UBR1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPB1Q9UBR1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UPB1Q9UBR1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPB1Q9UBR1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UPB1Q9UBR1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPB1Q9UBR1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPB1Q9UBR1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UPB1Q9UBR1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UPB1Q9UBR1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UPB1Q9UBR1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UPB1Q9UBR1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UPB1Q9UBR1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPB1Q9UBR1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UPB1Q9UBR1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UPB1Q9UBR1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UPB1Q9UBR1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPB1Q9UBR1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPB1Q9UBR1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPB1Q9UBR1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPB1Q9UBR1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPB1Q9UBR1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPB1Q9UBR1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPB1Q9UBR1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPB1Q9UBR1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPB1Q9UBR1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPB1Q9UBR1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPB1Q9UBR1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPB1Q9UBR1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPB1Q9UBR1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPB1Q9UBR1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPB1Q9UBR1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPB1Q9UBR1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPB1Q9UBR1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPB1Q9UBR1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPB1Q9UBR1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPB1Q9UBR1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UPB1Q9UBR1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPB1Q9UBR1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPB1Q9UBR1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPB1Q9UBR1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPB1Q9UBR1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPB1Q9UBR1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPB1Q9UBR1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPB1Q9UBR1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPB1Q9UBR1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPB1Q9UBR1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPB1Q9UBR1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.5 ms