Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00474Q9P2X8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00474Q9P2X8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00474Q9P2X8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00474Q9P2X8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00474Q9P2X8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00474Q9P2X8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00474Q9P2X8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00474Q9P2X8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00474Q9P2X8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms