Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L2

MARK1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK1Q9P0L2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MARK1Q9P0L2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MARK1Q9P0L2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MARK1Q9P0L2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARK1Q9P0L2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MARK1Q9P0L2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MARK1Q9P0L2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARK1Q9P0L2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARK1Q9P0L2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MARK1Q9P0L2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARK1Q9P0L2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARK1Q9P0L2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARK1Q9P0L2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARK1Q9P0L2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MARK1Q9P0L2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MARK1Q9P0L2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARK1Q9P0L2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARK1Q9P0L2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARK1Q9P0L2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARK1Q9P0L2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARK1Q9P0L2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MARK1Q9P0L2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARK1Q9P0L2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARK1Q9P0L2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARK1Q9P0L2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARK1Q9P0L2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MARK1Q9P0L2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MARK1Q9P0L2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARK1Q9P0L2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MARK1Q9P0L2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARK1Q9P0L2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARK1Q9P0L2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARK1Q9P0L2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARK1Q9P0L2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MARK1Q9P0L2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MARK1Q9P0L2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MARK1Q9P0L2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MARK1Q9P0L2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARK1Q9P0L2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARK1Q9P0L2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MARK1Q9P0L2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARK1Q9P0L2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARK1Q9P0L2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARK1Q9P0L2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MARK1Q9P0L2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARK1Q9P0L2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MARK1Q9P0L2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MARK1Q9P0L2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MARK1Q9P0L2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARK1Q9P0L2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARK1Q9P0L2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MARK1Q9P0L2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARK1Q9P0L2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MARK1Q9P0L2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MARK1Q9P0L2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARK1Q9P0L2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARK1Q9P0L2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARK1Q9P0L2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MARK1Q9P0L2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MARK1Q9P0L2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms