Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GIN1Q9NXP7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GIN1Q9NXP7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GIN1Q9NXP7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GIN1Q9NXP7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GIN1Q9NXP7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GIN1Q9NXP7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GIN1Q9NXP7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GIN1Q9NXP7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GIN1Q9NXP7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GIN1Q9NXP7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GIN1Q9NXP7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GIN1Q9NXP7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GIN1Q9NXP7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GIN1Q9NXP7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GIN1Q9NXP7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GIN1Q9NXP7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GIN1Q9NXP7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GIN1Q9NXP7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GIN1Q9NXP7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GIN1Q9NXP7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GIN1Q9NXP7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GIN1Q9NXP7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GIN1Q9NXP7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GIN1Q9NXP7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GIN1Q9NXP7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GIN1Q9NXP7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIN1Q9NXP7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GIN1Q9NXP7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GIN1Q9NXP7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GIN1Q9NXP7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GIN1Q9NXP7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GIN1Q9NXP7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GIN1Q9NXP7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GIN1Q9NXP7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GIN1Q9NXP7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GIN1Q9NXP7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GIN1Q9NXP7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GIN1Q9NXP7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GIN1Q9NXP7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GIN1Q9NXP7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIN1Q9NXP7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GIN1Q9NXP7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GIN1Q9NXP7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GIN1Q9NXP7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms