Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PARVAQ9NVD7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARVAQ9NVD7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARVAQ9NVD7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARVAQ9NVD7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARVAQ9NVD7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARVAQ9NVD7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARVAQ9NVD7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARVAQ9NVD7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PARVAQ9NVD7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARVAQ9NVD7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARVAQ9NVD7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARVAQ9NVD7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARVAQ9NVD7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARVAQ9NVD7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARVAQ9NVD7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARVAQ9NVD7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARVAQ9NVD7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARVAQ9NVD7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARVAQ9NVD7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARVAQ9NVD7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARVAQ9NVD7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARVAQ9NVD7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARVAQ9NVD7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARVAQ9NVD7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARVAQ9NVD7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARVAQ9NVD7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARVAQ9NVD7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARVAQ9NVD7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARVAQ9NVD7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARVAQ9NVD7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARVAQ9NVD7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARVAQ9NVD7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARVAQ9NVD7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARVAQ9NVD7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARVAQ9NVD7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARVAQ9NVD7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARVAQ9NVD7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARVAQ9NVD7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARVAQ9NVD7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARVAQ9NVD7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARVAQ9NVD7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARVAQ9NVD7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARVAQ9NVD7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARVAQ9NVD7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARVAQ9NVD7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PARVAQ9NVD7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARVAQ9NVD7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARVAQ9NVD7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARVAQ9NVD7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PARVAQ9NVD7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PARVAQ9NVD7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARVAQ9NVD7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARVAQ9NVD7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARVAQ9NVD7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARVAQ9NVD7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARVAQ9NVD7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARVAQ9NVD7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARVAQ9NVD7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PARVAQ9NVD7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARVAQ9NVD7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARVAQ9NVD7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARVAQ9NVD7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARVAQ9NVD7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARVAQ9NVD7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARVAQ9NVD7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARVAQ9NVD7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARVAQ9NVD7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms