Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3GQ9NS98 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3GQ9NS98 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3GQ9NS98 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3GQ9NS98 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3GQ9NS98 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3GQ9NS98 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3GQ9NS98 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3GQ9NS98 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3GQ9NS98 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3GQ9NS98 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3GQ9NS98 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3GQ9NS98 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3GQ9NS98 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3GQ9NS98 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3GQ9NS98 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3GQ9NS98 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3GQ9NS98 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3GQ9NS98 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3GQ9NS98 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3GQ9NS98 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3GQ9NS98 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3GQ9NS98 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3GQ9NS98 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3GQ9NS98 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3GQ9NS98 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3GQ9NS98 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3GQ9NS98 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3GQ9NS98 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3GQ9NS98 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3GQ9NS98 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3GQ9NS98 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3GQ9NS98 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3GQ9NS98 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3GQ9NS98 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3GQ9NS98 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEMA3GQ9NS98 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3GQ9NS98 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3GQ9NS98 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3GQ9NS98 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3GQ9NS98 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3GQ9NS98 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3GQ9NS98 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3GQ9NS98 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3GQ9NS98 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3GQ9NS98 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3GQ9NS98 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3GQ9NS98 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3GQ9NS98 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3GQ9NS98 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3GQ9NS98 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3GQ9NS98 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3GQ9NS98 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3GQ9NS98 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms