Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH3

TUBG2, Tubulin gamma-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG2Q9NRH3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBG2Q9NRH3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBG2Q9NRH3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBG2Q9NRH3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBG2Q9NRH3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBG2Q9NRH3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBG2Q9NRH3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBG2Q9NRH3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBG2Q9NRH3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBG2Q9NRH3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBG2Q9NRH3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBG2Q9NRH3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBG2Q9NRH3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBG2Q9NRH3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBG2Q9NRH3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBG2Q9NRH3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBG2Q9NRH3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBG2Q9NRH3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBG2Q9NRH3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBG2Q9NRH3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBG2Q9NRH3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBG2Q9NRH3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBG2Q9NRH3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBG2Q9NRH3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBG2Q9NRH3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBG2Q9NRH3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBG2Q9NRH3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBG2Q9NRH3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBG2Q9NRH3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBG2Q9NRH3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBG2Q9NRH3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBG2Q9NRH3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBG2Q9NRH3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBG2Q9NRH3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBG2Q9NRH3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBG2Q9NRH3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBG2Q9NRH3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBG2Q9NRH3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBG2Q9NRH3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBG2Q9NRH3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBG2Q9NRH3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBG2Q9NRH3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBG2Q9NRH3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBG2Q9NRH3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBG2Q9NRH3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBG2Q9NRH3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBG2Q9NRH3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBG2Q9NRH3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBG2Q9NRH3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBG2Q9NRH3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms