Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCUBE2Q9NQ36 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCUBE2Q9NQ36 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCUBE2Q9NQ36 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCUBE2Q9NQ36 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCUBE2Q9NQ36 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCUBE2Q9NQ36 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCUBE2Q9NQ36 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCUBE2Q9NQ36 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCUBE2Q9NQ36 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCUBE2Q9NQ36 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCUBE2Q9NQ36 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCUBE2Q9NQ36 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCUBE2Q9NQ36 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCUBE2Q9NQ36 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCUBE2Q9NQ36 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCUBE2Q9NQ36 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCUBE2Q9NQ36 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCUBE2Q9NQ36 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCUBE2Q9NQ36 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCUBE2Q9NQ36 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCUBE2Q9NQ36 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCUBE2Q9NQ36 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCUBE2Q9NQ36 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCUBE2Q9NQ36 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCUBE2Q9NQ36 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCUBE2Q9NQ36 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCUBE2Q9NQ36 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCUBE2Q9NQ36 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCUBE2Q9NQ36 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SCUBE2Q9NQ36 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCUBE2Q9NQ36 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCUBE2Q9NQ36 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCUBE2Q9NQ36 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCUBE2Q9NQ36 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCUBE2Q9NQ36 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCUBE2Q9NQ36 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCUBE2Q9NQ36 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCUBE2Q9NQ36 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCUBE2Q9NQ36 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCUBE2Q9NQ36 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCUBE2Q9NQ36 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCUBE2Q9NQ36 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCUBE2Q9NQ36 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCUBE2Q9NQ36 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCUBE2Q9NQ36 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCUBE2Q9NQ36 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCUBE2Q9NQ36 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms