Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE7BQ9NP56 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE7BQ9NP56 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE7BQ9NP56 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE7BQ9NP56 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE7BQ9NP56 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE7BQ9NP56 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE7BQ9NP56 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE7BQ9NP56 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE7BQ9NP56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE7BQ9NP56 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE7BQ9NP56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE7BQ9NP56 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE7BQ9NP56 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE7BQ9NP56 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE7BQ9NP56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE7BQ9NP56 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE7BQ9NP56 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE7BQ9NP56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE7BQ9NP56 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE7BQ9NP56 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE7BQ9NP56 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE7BQ9NP56 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE7BQ9NP56 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE7BQ9NP56 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE7BQ9NP56 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE7BQ9NP56 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE7BQ9NP56 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE7BQ9NP56 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE7BQ9NP56 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE7BQ9NP56 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE7BQ9NP56 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE7BQ9NP56 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE7BQ9NP56 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE7BQ9NP56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE7BQ9NP56 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE7BQ9NP56 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE7BQ9NP56 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE7BQ9NP56 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE7BQ9NP56 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE7BQ9NP56 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE7BQ9NP56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE7BQ9NP56 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE7BQ9NP56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms