Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
SENP3Q9H4L4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
SENP3Q9H4L4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SENP3Q9H4L4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SENP3Q9H4L4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SENP3Q9H4L4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
SENP3Q9H4L4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SENP3Q9H4L4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SENP3Q9H4L4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SENP3Q9H4L4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SENP3Q9H4L4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SENP3Q9H4L4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SENP3Q9H4L4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SENP3Q9H4L4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SENP3Q9H4L4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
SENP3Q9H4L4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SENP3Q9H4L4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SENP3Q9H4L4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SENP3Q9H4L4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SENP3Q9H4L4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
SENP3Q9H4L4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SENP3Q9H4L4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SENP3Q9H4L4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SENP3Q9H4L4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SENP3Q9H4L4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
SENP3Q9H4L4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SENP3Q9H4L4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SENP3Q9H4L4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SENP3Q9H4L4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
SENP3Q9H4L4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SENP3Q9H4L4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SENP3Q9H4L4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SENP3Q9H4L4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SENP3Q9H4L4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SENP3Q9H4L4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SENP3Q9H4L4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
SENP3Q9H4L4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SENP3Q9H4L4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SENP3Q9H4L4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
SENP3Q9H4L4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SENP3Q9H4L4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SENP3Q9H4L4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SENP3Q9H4L4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SENP3Q9H4L4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
SENP3Q9H4L4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SENP3Q9H4L4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SENP3Q9H4L4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SENP3Q9H4L4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SENP3Q9H4L4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SENP3Q9H4L4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SENP3Q9H4L4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SENP3Q9H4L4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SENP3Q9H4L4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SENP3Q9H4L4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SENP3Q9H4L4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.05■■■■■ 4
SENP3Q9H4L4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SENP3Q9H4L4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SENP3Q9H4L4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
SENP3Q9H4L4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SENP3Q9H4L4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SENP3Q9H4L4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SENP3Q9H4L4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SENP3Q9H4L4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SENP3Q9H4L4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SENP3Q9H4L4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SENP3Q9H4L4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SENP3Q9H4L4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
SENP3Q9H4L4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SENP3Q9H4L4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SENP3Q9H4L4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SENP3Q9H4L4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SENP3Q9H4L4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SENP3Q9H4L4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SENP3Q9H4L4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
SENP3Q9H4L4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SENP3Q9H4L4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SENP3Q9H4L4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SENP3Q9H4L4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SENP3Q9H4L4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SENP3Q9H4L4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SENP3Q9H4L4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms