Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SENP6Q9GZR1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP6Q9GZR1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SENP6Q9GZR1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
SENP6Q9GZR1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SENP6Q9GZR1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP6Q9GZR1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP6Q9GZR1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SENP6Q9GZR1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SENP6Q9GZR1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SENP6Q9GZR1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SENP6Q9GZR1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SENP6Q9GZR1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP6Q9GZR1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SENP6Q9GZR1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SENP6Q9GZR1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SENP6Q9GZR1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SENP6Q9GZR1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SENP6Q9GZR1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP6Q9GZR1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP6Q9GZR1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP6Q9GZR1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SENP6Q9GZR1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SENP6Q9GZR1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SENP6Q9GZR1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP6Q9GZR1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP6Q9GZR1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP6Q9GZR1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SENP6Q9GZR1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SENP6Q9GZR1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SENP6Q9GZR1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
SENP6Q9GZR1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SENP6Q9GZR1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SENP6Q9GZR1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SENP6Q9GZR1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SENP6Q9GZR1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SENP6Q9GZR1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SENP6Q9GZR1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SENP6Q9GZR1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SENP6Q9GZR1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SENP6Q9GZR1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SENP6Q9GZR1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SENP6Q9GZR1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SENP6Q9GZR1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SENP6Q9GZR1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SENP6Q9GZR1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SENP6Q9GZR1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SENP6Q9GZR1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SENP6Q9GZR1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SENP6Q9GZR1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SENP6Q9GZR1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SENP6Q9GZR1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SENP6Q9GZR1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SENP6Q9GZR1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SENP6Q9GZR1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SENP6Q9GZR1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SENP6Q9GZR1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SENP6Q9GZR1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SENP6Q9GZR1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SENP6Q9GZR1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SENP6Q9GZR1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SENP6Q9GZR1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SENP6Q9GZR1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP6Q9GZR1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SENP6Q9GZR1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP6Q9GZR1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SENP6Q9GZR1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SENP6Q9GZR1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SENP6Q9GZR1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SENP6Q9GZR1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SENP6Q9GZR1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SENP6Q9GZR1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SENP6Q9GZR1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SENP6Q9GZR1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SENP6Q9GZR1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SENP6Q9GZR1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SENP6Q9GZR1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SENP6Q9GZR1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SENP6Q9GZR1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SENP6Q9GZR1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SENP6Q9GZR1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SENP6Q9GZR1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SENP6Q9GZR1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP6Q9GZR1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SENP6Q9GZR1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SENP6Q9GZR1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SENP6Q9GZR1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SENP6Q9GZR1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP6Q9GZR1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP6Q9GZR1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SENP6Q9GZR1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SENP6Q9GZR1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SENP6Q9GZR1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP6Q9GZR1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP6Q9GZR1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SENP6Q9GZR1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SENP6Q9GZR1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SENP6Q9GZR1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SENP6Q9GZR1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SENP6Q9GZR1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms