Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ6

NPFFR1, Neuropeptide FF receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPFFR1Q9GZQ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPFFR1Q9GZQ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPFFR1Q9GZQ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPFFR1Q9GZQ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPFFR1Q9GZQ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPFFR1Q9GZQ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPFFR1Q9GZQ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPFFR1Q9GZQ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPFFR1Q9GZQ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPFFR1Q9GZQ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPFFR1Q9GZQ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPFFR1Q9GZQ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPFFR1Q9GZQ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPFFR1Q9GZQ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPFFR1Q9GZQ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPFFR1Q9GZQ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPFFR1Q9GZQ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPFFR1Q9GZQ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPFFR1Q9GZQ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPFFR1Q9GZQ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NPFFR1Q9GZQ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPFFR1Q9GZQ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPFFR1Q9GZQ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPFFR1Q9GZQ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPFFR1Q9GZQ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPFFR1Q9GZQ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPFFR1Q9GZQ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NPFFR1Q9GZQ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPFFR1Q9GZQ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPFFR1Q9GZQ6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPFFR1Q9GZQ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPFFR1Q9GZQ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NPFFR1Q9GZQ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPFFR1Q9GZQ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NPFFR1Q9GZQ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPFFR1Q9GZQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPFFR1Q9GZQ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPFFR1Q9GZQ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPFFR1Q9GZQ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPFFR1Q9GZQ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPFFR1Q9GZQ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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