Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A5Q9BY07 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A5Q9BY07 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A5Q9BY07 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A5Q9BY07 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A5Q9BY07 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A5Q9BY07 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A5Q9BY07 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A5Q9BY07 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLC4A5Q9BY07 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A5Q9BY07 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A5Q9BY07 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A5Q9BY07 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A5Q9BY07 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A5Q9BY07 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC4A5Q9BY07 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A5Q9BY07 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A5Q9BY07 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A5Q9BY07 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A5Q9BY07 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A5Q9BY07 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A5Q9BY07 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A5Q9BY07 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A5Q9BY07 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A5Q9BY07 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A5Q9BY07 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A5Q9BY07 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A5Q9BY07 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A5Q9BY07 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A5Q9BY07 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A5Q9BY07 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A5Q9BY07 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A5Q9BY07 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A5Q9BY07 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A5Q9BY07 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A5Q9BY07 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A5Q9BY07 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A5Q9BY07 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A5Q9BY07 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A5Q9BY07 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A5Q9BY07 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A5Q9BY07 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A5Q9BY07 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A5Q9BY07 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A5Q9BY07 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A5Q9BY07 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A5Q9BY07 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A5Q9BY07 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A5Q9BY07 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A5Q9BY07 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A5Q9BY07 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A5Q9BY07 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A5Q9BY07 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A5Q9BY07 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A5Q9BY07 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A5Q9BY07 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A5Q9BY07 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms