Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
STRA6Q9BX79 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
STRA6Q9BX79 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
STRA6Q9BX79 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
STRA6Q9BX79 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
STRA6Q9BX79 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
STRA6Q9BX79 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
STRA6Q9BX79 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
STRA6Q9BX79 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
STRA6Q9BX79 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
STRA6Q9BX79 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
STRA6Q9BX79 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRA6Q9BX79 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRA6Q9BX79 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
STRA6Q9BX79 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRA6Q9BX79 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRA6Q9BX79 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRA6Q9BX79 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRA6Q9BX79 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRA6Q9BX79 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
STRA6Q9BX79 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
STRA6Q9BX79 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRA6Q9BX79 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRA6Q9BX79 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRA6Q9BX79 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRA6Q9BX79 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRA6Q9BX79 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRA6Q9BX79 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
STRA6Q9BX79 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRA6Q9BX79 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
STRA6Q9BX79 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
STRA6Q9BX79 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
STRA6Q9BX79 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
STRA6Q9BX79 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
STRA6Q9BX79 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
STRA6Q9BX79 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
STRA6Q9BX79 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
STRA6Q9BX79 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
STRA6Q9BX79 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRA6Q9BX79 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRA6Q9BX79 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
STRA6Q9BX79 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRA6Q9BX79 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRA6Q9BX79 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRA6Q9BX79 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRA6Q9BX79 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRA6Q9BX79 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRA6Q9BX79 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRA6Q9BX79 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRA6Q9BX79 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRA6Q9BX79 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRA6Q9BX79 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRA6Q9BX79 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
STRA6Q9BX79 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
STRA6Q9BX79 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STRA6Q9BX79 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
STRA6Q9BX79 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRA6Q9BX79 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRA6Q9BX79 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRA6Q9BX79 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRA6Q9BX79 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRA6Q9BX79 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRA6Q9BX79 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRA6Q9BX79 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRA6Q9BX79 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRA6Q9BX79 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms