Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBED2Q9BTP6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBED2Q9BTP6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBED2Q9BTP6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED2Q9BTP6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED2Q9BTP6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZBED2Q9BTP6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZBED2Q9BTP6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZBED2Q9BTP6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZBED2Q9BTP6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBED2Q9BTP6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBED2Q9BTP6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED2Q9BTP6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED2Q9BTP6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED2Q9BTP6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED2Q9BTP6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZBED2Q9BTP6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZBED2Q9BTP6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZBED2Q9BTP6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZBED2Q9BTP6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZBED2Q9BTP6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZBED2Q9BTP6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZBED2Q9BTP6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZBED2Q9BTP6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZBED2Q9BTP6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZBED2Q9BTP6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZBED2Q9BTP6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZBED2Q9BTP6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ZBED2Q9BTP6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZBED2Q9BTP6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED2Q9BTP6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ZBED2Q9BTP6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZBED2Q9BTP6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED2Q9BTP6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED2Q9BTP6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZBED2Q9BTP6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ZBED2Q9BTP6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZBED2Q9BTP6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ZBED2Q9BTP6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZBED2Q9BTP6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ZBED2Q9BTP6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZBED2Q9BTP6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ZBED2Q9BTP6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZBED2Q9BTP6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZBED2Q9BTP6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED2Q9BTP6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED2Q9BTP6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZBED2Q9BTP6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZBED2Q9BTP6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED2Q9BTP6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZBED2Q9BTP6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZBED2Q9BTP6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZBED2Q9BTP6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZBED2Q9BTP6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZBED2Q9BTP6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZBED2Q9BTP6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZBED2Q9BTP6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZBED2Q9BTP6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZBED2Q9BTP6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZBED2Q9BTP6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZBED2Q9BTP6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZBED2Q9BTP6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZBED2Q9BTP6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED2Q9BTP6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED2Q9BTP6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED2Q9BTP6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED2Q9BTP6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED2Q9BTP6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED2Q9BTP6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED2Q9BTP6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED2Q9BTP6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZBED2Q9BTP6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZBED2Q9BTP6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZBED2Q9BTP6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZBED2Q9BTP6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZBED2Q9BTP6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZBED2Q9BTP6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms