Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNS3Q9BQ31 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNS3Q9BQ31 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNS3Q9BQ31 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNS3Q9BQ31 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNS3Q9BQ31 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNS3Q9BQ31 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNS3Q9BQ31 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNS3Q9BQ31 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNS3Q9BQ31 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNS3Q9BQ31 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNS3Q9BQ31 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNS3Q9BQ31 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNS3Q9BQ31 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNS3Q9BQ31 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNS3Q9BQ31 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNS3Q9BQ31 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNS3Q9BQ31 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNS3Q9BQ31 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNS3Q9BQ31 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNS3Q9BQ31 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNS3Q9BQ31 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNS3Q9BQ31 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNS3Q9BQ31 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNS3Q9BQ31 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNS3Q9BQ31 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNS3Q9BQ31 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNS3Q9BQ31 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNS3Q9BQ31 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNS3Q9BQ31 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms