Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SIN3AQ96ST3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SIN3AQ96ST3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SIN3AQ96ST3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SIN3AQ96ST3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SIN3AQ96ST3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
SIN3AQ96ST3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SIN3AQ96ST3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SIN3AQ96ST3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SIN3AQ96ST3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SIN3AQ96ST3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SIN3AQ96ST3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SIN3AQ96ST3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SIN3AQ96ST3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SIN3AQ96ST3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SIN3AQ96ST3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SIN3AQ96ST3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SIN3AQ96ST3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SIN3AQ96ST3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SIN3AQ96ST3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SIN3AQ96ST3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SIN3AQ96ST3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SIN3AQ96ST3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
SIN3AQ96ST3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SIN3AQ96ST3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SIN3AQ96ST3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SIN3AQ96ST3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SIN3AQ96ST3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SIN3AQ96ST3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SIN3AQ96ST3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SIN3AQ96ST3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SIN3AQ96ST3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
SIN3AQ96ST3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SIN3AQ96ST3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SIN3AQ96ST3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SIN3AQ96ST3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SIN3AQ96ST3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SIN3AQ96ST3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SIN3AQ96ST3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
SIN3AQ96ST3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SIN3AQ96ST3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SIN3AQ96ST3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SIN3AQ96ST3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SIN3AQ96ST3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SIN3AQ96ST3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SIN3AQ96ST3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SIN3AQ96ST3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SIN3AQ96ST3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SIN3AQ96ST3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SIN3AQ96ST3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SIN3AQ96ST3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SIN3AQ96ST3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SIN3AQ96ST3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SIN3AQ96ST3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SIN3AQ96ST3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SIN3AQ96ST3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
SIN3AQ96ST3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SIN3AQ96ST3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SIN3AQ96ST3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
SIN3AQ96ST3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SIN3AQ96ST3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SIN3AQ96ST3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.01■■■■■ 4
SIN3AQ96ST3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SIN3AQ96ST3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SIN3AQ96ST3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SIN3AQ96ST3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SIN3AQ96ST3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SIN3AQ96ST3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SIN3AQ96ST3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SIN3AQ96ST3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SIN3AQ96ST3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SIN3AQ96ST3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SIN3AQ96ST3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SIN3AQ96ST3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
SIN3AQ96ST3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SIN3AQ96ST3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SIN3AQ96ST3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SIN3AQ96ST3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SIN3AQ96ST3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
SIN3AQ96ST3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
SIN3AQ96ST3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SIN3AQ96ST3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SIN3AQ96ST3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SIN3AQ96ST3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SIN3AQ96ST3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SIN3AQ96ST3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SIN3AQ96ST3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
SIN3AQ96ST3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms