Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
WRNIP1Q96S55 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
WRNIP1Q96S55 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
WRNIP1Q96S55 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
WRNIP1Q96S55 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
WRNIP1Q96S55 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
WRNIP1Q96S55 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
WRNIP1Q96S55 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
WRNIP1Q96S55 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
WRNIP1Q96S55 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
WRNIP1Q96S55 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
WRNIP1Q96S55 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
WRNIP1Q96S55 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
WRNIP1Q96S55 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
WRNIP1Q96S55 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
WRNIP1Q96S55 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
WRNIP1Q96S55 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
WRNIP1Q96S55 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
WRNIP1Q96S55 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
WRNIP1Q96S55 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
WRNIP1Q96S55 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
WRNIP1Q96S55 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
WRNIP1Q96S55 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
WRNIP1Q96S55 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
WRNIP1Q96S55 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
WRNIP1Q96S55 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
WRNIP1Q96S55 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
WRNIP1Q96S55 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
WRNIP1Q96S55 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
WRNIP1Q96S55 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
WRNIP1Q96S55 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
WRNIP1Q96S55 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
WRNIP1Q96S55 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
WRNIP1Q96S55 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
WRNIP1Q96S55 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
WRNIP1Q96S55 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
WRNIP1Q96S55 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
WRNIP1Q96S55 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
WRNIP1Q96S55 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
WRNIP1Q96S55 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
WRNIP1Q96S55 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
WRNIP1Q96S55 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
WRNIP1Q96S55 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
WRNIP1Q96S55 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
WRNIP1Q96S55 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
WRNIP1Q96S55 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
WRNIP1Q96S55 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
WRNIP1Q96S55 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
WRNIP1Q96S55 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
WRNIP1Q96S55 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
WRNIP1Q96S55 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
WRNIP1Q96S55 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
WRNIP1Q96S55 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
WRNIP1Q96S55 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
WRNIP1Q96S55 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
WRNIP1Q96S55 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
WRNIP1Q96S55 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
WRNIP1Q96S55 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
WRNIP1Q96S55 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
WRNIP1Q96S55 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
WRNIP1Q96S55 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
WRNIP1Q96S55 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
WRNIP1Q96S55 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
WRNIP1Q96S55 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
WRNIP1Q96S55 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
WRNIP1Q96S55 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
WRNIP1Q96S55 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
WRNIP1Q96S55 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
WRNIP1Q96S55 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
WRNIP1Q96S55 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
WRNIP1Q96S55 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
WRNIP1Q96S55 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
WRNIP1Q96S55 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
WRNIP1Q96S55 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
WRNIP1Q96S55 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
WRNIP1Q96S55 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
WRNIP1Q96S55 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
WRNIP1Q96S55 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
WRNIP1Q96S55 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
WRNIP1Q96S55 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
WRNIP1Q96S55 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
WRNIP1Q96S55 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
WRNIP1Q96S55 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
WRNIP1Q96S55 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
WRNIP1Q96S55 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
WRNIP1Q96S55 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
WRNIP1Q96S55 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
WRNIP1Q96S55 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
WRNIP1Q96S55 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
WRNIP1Q96S55 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms