Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC114Q96M63 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC114Q96M63 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC114Q96M63 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC114Q96M63 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC114Q96M63 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC114Q96M63 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC114Q96M63 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC114Q96M63 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC114Q96M63 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC114Q96M63 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC114Q96M63 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC114Q96M63 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC114Q96M63 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC114Q96M63 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC114Q96M63 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC114Q96M63 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC114Q96M63 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC114Q96M63 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC114Q96M63 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC114Q96M63 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC114Q96M63 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC114Q96M63 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC114Q96M63 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC114Q96M63 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC114Q96M63 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC114Q96M63 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC114Q96M63 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC114Q96M63 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC114Q96M63 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC114Q96M63 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC114Q96M63 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC114Q96M63 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC114Q96M63 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC114Q96M63 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC114Q96M63 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC114Q96M63 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC114Q96M63 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC114Q96M63 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC114Q96M63 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC114Q96M63 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC114Q96M63 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC114Q96M63 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC114Q96M63 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC114Q96M63 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC114Q96M63 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC114Q96M63 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC114Q96M63 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC114Q96M63 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC114Q96M63 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC114Q96M63 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC114Q96M63 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC114Q96M63 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC114Q96M63 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC114Q96M63 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC114Q96M63 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC114Q96M63 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC114Q96M63 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC114Q96M63 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC114Q96M63 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC114Q96M63 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC114Q96M63 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC114Q96M63 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC114Q96M63 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC114Q96M63 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC114Q96M63 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC114Q96M63 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC114Q96M63 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC114Q96M63 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC114Q96M63 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC114Q96M63 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC114Q96M63 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC114Q96M63 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC114Q96M63 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC114Q96M63 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC114Q96M63 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC114Q96M63 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC114Q96M63 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms